Ubuntu16下编译安装Open Babel2.4.1和python绑定

来源：互联网发布：淘宝质量好的男装店编辑：程序博客网时间：2024/05/30 13:42

上一篇介绍的是CentOS 7下编译安装Open Babel2.4.1和python绑定点击打开链接

一、Open Babel简介

Open Babel是一款开源自由软件，使用Open Babel可以将一种化学结构类型的文件格式转换成另一种文件格式，非常方便的进行各种类型的化学结构文件进行相互转换。

Open Babel由CC++编写，并提供C ++， Perl， Python等的API接口方便开发。

二、Open Babel 2.4.1的编译安装并绑定Python

第一步：下载openbabel 2.4.1安装包

下载地址：https://github.com/openbabel/openbabel/releases点击打开链接

第二步：安装boost库

su root               #获取root权限apt install libboost-dev   # 安装boost库

第三步：安装gcc、g++、make、cmkae

apt install gccapt install g++apt install makeapt install cmake

第四步：安装依赖的开发库

apt install libxml2-devapt install zlib1g-devapt install libcairo2-devapt install libeigen2-dev apt install libopenbabel-dev

第五步：支持Python（Python2.7）绑定，安装python开发库

apt install python-dev

第六步：编译安装

tar zxvf openbabel-2.4.1.tar.gzmkdir buildcd buildcmake ../openbabel-2.4.1 -DPYTHON_BINDINGS=ON      #编译安装Python绑定 makemake testmake install

第七步：环境变量添加

gedit ~/.bashrc#open babelexport PATH=/usr/local/bin:$PATHexport LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/libexport PYTHONPATH=/usr/local/lib/python2.7/site-packages:$PYTHONPATH   #Python路径添加source ~/.bashrc

最后一步：检查Open Babel 2.4.1和Python绑定是否安装成功

检查Open Babel 2.4.1

Python绑定是否安装成功

###################CC++ example的编译###########################

/*example.cpp*/

#include <iostream>#include <openbabel/obconversion.h>using namespace std;int main(int argc,char **argv){if(argc<3){cout << "Usage: ProgrameName InputFileName OutputFileName\n";return 1;}ifstream ifs(argv[1]);if(!ifs){cout << "Cannot open input file\n";return 1;}ofstream ofs(argv[2]);if(!ofs){cout << "Cannot open output file\n";return 1;}OpenBabel::OBConversion conv(&ifs, &ofs);if(!conv.SetInAndOutFormats("CML","MOL")){cout << "Formats not available\n";return 1;}int n = conv.Convert();cout << n << " molecules converted\n";return 0;}

编译命令：

g++ example.cpp -I /usr/local/include/openbabel-2.0 -lopenbabel

效果图：

#################################################################################################################################

欢迎关注药设之道

阅读全文

1 0