R语言利用caret包比较ROC曲线

来源:互联网 发布:mysql表结构导出word 编辑:程序博客网 时间:2024/06/05 08:43

说明

我们之前探讨了多种算法,每种算法都有优缺点,因而当我们针对具体问题去判断选择那种算法时,必须对不同的预测模型进行重做评估。为了简化这个过程,我们使用caret包来生成并比较不同的模型与性能。

操作

加载对应的包与将训练控制算法设置为10折交叉验证,重复次数为3:

library(ROCR)library(e1071)library("pROC")library(caret)library("pROC")control = trainControl(method = "repaetedcv",                       number = 10,                       repeats =3,                       classProbs = TRUE,                       summaryFunction = twoClassSummary)

使用glm在训练数据集上训练一个分类器

glm.model = train(churn ~ .,                  data= trainset,                  method = "glm",                  metric = "ROC",                  trControl = control)

使用svm在训练数据集上训练一个分类器

svm.model = train(churn ~ .,                  data= trainset,                  method = "svmRadial",                  metric = "ROC",                  trControl = control)

使用rpart函数查看rpart在训练数据集上的运行情况

rpart.model = train(churn ~ .,                    data = trainset,                    method = "svmRadial",                    metric = "ROC",                    trControl = control)

使用不同的已经训练好的数据分类预测:

glm.probs = predict(glm.model,testset[,!names(testset) %in% c("churn")],type = "prob")svm.probs = predict(svm.model,testset[,!names(testset) %in% c("churn")],type = "prob")rpart.probs = predict(rpart.model,testset[,!names(testset) %in% c("churn")],type = "prob")

生成每个模型的ROC曲线,将它们绘制在一个图中:

glm.ROC = roc(response = testset[,c("churn")],              predictor = glm.probs$yes,              levels = levels(testset[,c("churn")]))plot(glm.ROC,type = "S",col = "red")svm.ROC = roc(response = testset[,c("churn")],              predictor = svm.probs$yes,              levels = levels(testset[,c("churn")]))plot(svm.ROC,add = TRUE,col = "green")rpart.ROC = roc(response = testset[,c("churn")],              predictor = rpart.probs$yes,              levels = levels(testset[,c("churn")]))plot(rpart.ROC,add = TRUE,col = "blue")

三种分类器的ROC曲线
三种分类器的ROC曲线

说明

将不同的分类模型的ROC曲线绘制在同一个图中进行比较,设置训练过程的控制参数为重复三次的10折交叉验证,模型性能的评估参数为twoClassSummary,然后在使用glm,svm,rpart,三种不同的方法建立分类模型。
从图中可以看出,svm对训练集的预测结果(未调优)是三种分类算法里最好的。

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