Football数据集可视化处理——gephi可视化处理数据
来源:互联网 发布:大姨吗数据和美柚同步 编辑:程序博客网 时间:2024/05/16 16:20
1 football数据集的文件格式
根据如图所示football数据集和的文件格式如下所示:
下图表示football数据集节点部分信息
下图表示football数据集边的部分信息
根据上述两个图中的格式对football数据集的格式介绍可以介绍为如下所示:
Creator "Mark Newman on Sat Jul 22 05:32:16 2006"graph[ node [ id ** value ** label **** ] ... node [ id ** value ** label **** ] edge [ id ** value ** label **** ] ... edge [ id *** value ** label **** ]]
2 football数据集文件格式的转化
根据上述的football文件,我们将数据文件转化成两个文件,这两个文件分别用来存储football数据集的边信息和节点信息,对football数据集文件的处理如下。
2.1 football数据集节点信息文件
根据gephi通过csv导入信息的需要,我们将数据信息处理成如下的数据集节点文件格式:
Id Label Value1 Tom 32 Bob 4
在football数据集中将football.gml文件处理得到的结果如下所示:
其中:
Id:用于标识唯一的一个点Label:标识节点的标签或者是名称Value:标识节点的所属的社区。
2.2 football数据集边信息文件
根据gephi通过csv导入数据的格式,我们分为有向图和无向图两种数据格式,对于有向图的导入数据格式如下所示:
Source Target Weight1 3 22 4 1
根据上述公式:Source:表示源节点Target:表示目的结点Weight:表示对应的边的权重
在无向图的导入中需要加入Type类型得出的数据格式如下所示:
Source Target Weigth Type1 3 2 Undirected2 4 1 Undirected
如下图所示为football数据集的数据个格式,football数据集是无权图因此没有有weight。
在football数据集的616条边中有三条边是重复出现的分别为
28 1885 4100 15
在通过gephi对这些边进行模块化社区划分运算的时候需要将这些边删除,否则无法运行。
2.3 对football.gml处理代码
#include <iostream>#include <stdio.h>#include <string.h>#include <stdlib.h>using namespace std;int main(){ FILE* inputfile = NULL; FILE* nodefile = NULL; FILE* edgefile = NULL; inputfile = fopen("football.gml","r"); nodefile = fopen("nodefile.txt","w"); edgefile = fopen("edgefile.txt","w"); fprintf(nodefile, "Id Label Value\n"); fprintf(edgefile,"Source Target Type\n"); char strLine[1024]; int i = 0; int node = 0; int edge = 0; //char nodeinfo[100]; char edgeinfo[100]; while(!feof(inputfile)) { fgets(strLine,1024, inputfile); if(strncmp(strLine+4,"id",2)==0 ) { char id[5]; char label[50]; char value[5]; memset(label,0,50); int idint = 0, valueint = 0; int copylen = 0; copylen = strlen(strLine) - 8; strncpy(id,strLine+7,copylen); idint = atoi(id)+1; fgets(strLine,1024, inputfile); copylen = strlen(strLine) - 13; strncpy(label,strLine+11,copylen); fgets(strLine,1024, inputfile); copylen = strlen(strLine) - 10; strncpy(value,strLine+10,copylen); valueint = atoi(value)+1; //cout << valueint << endl; fprintf(nodefile,"%d %s %d\n",idint,label,valueint); } if(strncmp(strLine+4,"source",6)==0) { char target[5]; char source[5]; int sourceint = 0,targetint = 0; memset(target,0,5); memset(source,0,5); int copylen = 0; copylen = strlen(strLine)-12; strncpy(source,strLine+11,copylen); sourceint = atoi(source)+1; fgets(strLine,1024, inputfile); copylen = strlen(strLine)-12; strncpy(target,strLine+11,copylen); targetint = atoi(target)+1; fprintf(edgefile,"%d %d undirected\n",sourceint,targetint); } } fclose(nodefile); fclose(edgefile); return 0;}
3 gephi点表和边表的导入并生成football图像
(1)点击文件->Import spreadsheet如下图所示:
(2)选择需要导入的文件进行数据导入
注意选择导入的是边表格还是点表格
(3)点击模块化
(4)设置参数为0.4
(5)选择节点的渲染方式为Modularity Class
(6)得到football的社区划分和真实社区对比
football数据集通过gephi进行社区划分的结果(不带有边的图)
football数据集真实社区的结果(不带有边的图)
football数据集通过gephi进行社区划分的结果(带有边的图)
football数据集真实社区的结果(带有边的图)
根据上述的结果我们可以对比得到gephi生成的社区和真实社区的差别,并且最终得到如下所示的两张对比图片。
gephi基于模块度生成社区划分的图片
football给出的标签的真实社区图片
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