CentOS 安装caffe步骤（非root、仅CPU、OpenBLAS、Intel MKL）

安装过程出现了各种问题，在网上找了各种的解决方案，好在最后成功了，以下是我的安装情况：

一、安装依赖的库

1、protobuf
下载：https://github.com/google/protobuf/releases/download/v3.4.0/protobuf-cpp-3.4.0.zip
./configure --prefix=指定安装目录
make（make -j24 加速）
make check
make install
可能遇到的问题：usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.11' not found (required by /data03/WaterMark/protobuf-3.4.0/src/.libs/libprotobuf.so.14)
系统使用的c++版本过低，使用strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX 可以查看当前支持的版本
解决办法：
（1）系统升级libstdc++.so（需root权限）
（2）下载高版本的c++，然后设置LD_LIBRARY_PATH，再执行上面的步骤

2、leveldb
下载：https://github.com/google/leveldb/archive/v1.20.zip
安装：make
生成的动态库在out-shared目录

3、snappy
下载：https://github.com/google/snappy/releases/download/1.1.4/snappy-1.1.4.tar.gz
./configure --prefix=指定安装目录
make
make install

4、opencv
机器上已有动态库，没安装，直接拷贝了include和libopencv*

5、boost
下载：https://dl.bintray.com/boostorg/release/1.64.0/source/boost_1_64_0.tar.gz
cd boost_1_64_0
./bootstrap.sh –with-libraries=all --prefix=指定安装目录 –with-toolset==gcc-4.4（此参数可以指定使用的gcc版本）
./b2
./b2 install


6、hdf5
下载：https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/ 下载的gzip类型
./configure --prefix=指定安装目录
make（时间长）
make check（时间长）
make install
make check-install

7、glog
wget --no-check-certificate https://storage.googleapis.com/google-code-archive-downloads/v2/code.google.com/google-glog/glog-0.3.3.tar.gz
./configure --prefix=指定安装目录
make
make install

8、gflags
wget --no-check-certificate https://github.com/schuhschuh/gflags/archive/master.zip
mkdir build && cd build
export CXXFLAGS="-fPIC" && cmake .. && make VERBOSE=1
make && make install
安装完的include和lib在build/
遇到的问题：安装包里没有configue，需要安装cmake
cmake下载：https://cmake.org/files/v3.9/cmake-3.9.1.tar.gz

9、lmdb
下载页面：https://github.com/LMDB/lmdb
cd lmdb/libraries/liblmdb
make && make install
安装完的include和lib在当前目录下

10、atlas
可用于安装的选项：（ATLAS、Intel MKL、OpenBLAS，速度：Intel MKL (70+毫秒) > OpenBLAS (1秒)）
（1）由于安装ATLAS的时候报错，选择安装OpenBLAS：
下载：http://github.com/xianyi/OpenBLAS/archive/v0.2.20.tar.gz
make NO_LAPACK=1（不包含LAPACK）
make PREFIX=指定安装目录 install
遇到的问题：
make的时候如果不设置“NO_LAPACK=1”，会报错：cannot find -lgfortran
（2）由于OpenBLAS速度慢，换用Intel MKL（针对cpu优化了，速度快）
下载页面：https://software.intel.com/en-us/mkl
需要先注册（免费），然后得到一个授权码（个人信息里可以找到Serial Number）
我下载的版本是：l_mkl_2017.3.196.tgz
解压缩之后执行里面的install.sh，按照提示进行安装，里面有选项可以选择安装目录，授权的时候输入上面的Serial Number
如果中途退出的话，服务器里会残留安装信息，在清理之前无法重新安装，怎么清理、保留多久均不知道
此版本要求centos版本6以上
安装完成之后需要找到mklvars.sh，并执行source mklvars.sh intel64（此步骤怀疑可省略，待验证）
如果非root权限，需要使用的文件为：
安装目录/mkl/bin
安装目录/mkl/include
安装目录/mkl/lib/intel64
安装目录/compilers_and_libraries/linux/lib/intel64

11、cuda
用于gpu，此处不安装

二、安装caffe
1、下载：https://github.com/BVLC/caffe/archive/master.zip

2、修改配置文件：
cp Makefile.config.example Makefile.config
如果没有GPU，取消注释：CPU_ONLY := 1
如果安装了OpenBLAS，将BLAS := atlas改成 BLAS := open
（如果安装了Intel MKL，将BLAS := atlas改成 BLAS := mkl）
设置BLAS_INCLUDE和BLAS_LIB
如果使用了opencv3版本，注释掉OPENCV_VERSION := 3
由于不需要使用python，注释掉PYTHON_INCLUDE目录

make all -j24（24表示计算机内核数）
make test
make runtest
可能出现的问题：
（1）./include/caffe/util/signal_handler.h:4:34: 致命错误：caffe/proto/caffe.pb.h：没有那个文件或目录
解决方案:
# 先进入caffe源码的根目录，然后执行：
protoc src/caffe/proto/caffe.proto --cpp_out=.
mkdir include/caffe/proto
mv src/caffe/proto/caffe.pb.h include/caffe/proto
（2）依赖库未安装在默认目录的情况，需要在makefile里指定路径，如增加：
CUSTOM_INCLUDE := 指定目录/include/
CUSTOM_LIB := 指定目录/lib/
LIBRARY_DIRS += $(CUSTOM_LIB)
INCLUDE_DIRS += $(CUSTOM_INCLUDE)

（3）系统默认使用的c++版本是：CXX ?= /usr/bin/g++，如果该版本过低，在makefile里改成指定版本路径的

（4）make runtest的时候报错：
symbol lookup error: libmkl_intel_thread.so: undefined symbol: omp_get_num_procs
原因：安装完Intel MKL之后，没有把安装目录/compilers_and_libraries/linux/lib/intel64里的动态库拷过来

三、将动态库挪到其他机器的时候可能出现gcc版本太低的问题
1、安装gcc
（1）下载4.8.0：wget http://ftp.gnu.org/gnu/gcc/gcc-4.8.0/gcc-4.8.0.tar.bz2
tar -jxvf  gcc-4.8.0.tar.bz2
（2）下载编译所需的依赖项
cd gcc-4.8.0　
./contrib/download_prerequisites　
cd ..
（3）建立编译输出目录
mkdir build-gcc-4.8.0
（4）进入此目录，执行以下命令，生成makefile文件
cd  build-gcc-4.8.0
../gcc-4.8.0/configure --enable-checking=release --enable-languages=c,c++ --disable-multilib --prefix=指定安装目录
make -j24

make install

另外，以上安装过程由于非root权限，可能需要将安装库的相关目录加入到环境变量：

PATH、CPLUS_INCLUDE_PAT、C_INCLUDE_PATH、LD_LIBRARY_PATH、LIBRARY_PATH

比如高版本的gcc，需要设置PATH，设置完成之后调用gcc -v，g++ -v 进行验证