Linux（64位）下OpenBabel 2.4.1、python2.7和Ipython实战（三）

Python调用OpenBabel的API，输出sdf文件中分子的分子量

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第一种方式

from pybel import *

for molecule in readfile("sdf","Sofosbuvir.sdf"):
    print molecule.molwt

第二种方式

from openbabel import *obconversion = OBConversion()obconversion.SetInFormat("sdf")obmol = OBMol()notatend = obconversion.ReadFile(obmol,"Sofosbuvir.sdf")while notatend:    print obmol.GetMolWt()    obmol = OBMol()    notatend = obconversion.Read(obmol)

多分子sdf文件中分子的分子量输出

实例

from pybel import *for molecule in readfile("sdf","NatProduct.sdf"):    print molecule.molwt