Apache Beam 快速入门(Python 版)

来源:互联网 发布:js文字超出显示省略号 编辑:程序博客网 时间:2024/06/05 21:48

Apache Beam 是一种大数据处理标准,由谷歌于 2016 年创建。它提供了一套统一的 DSL 用以处理离线和实时数据,并能在目前主流的大数据处理平台上使用,包括 Spark、Flink、以及谷歌自身的商业套件 Dataflow。Beam 的数据模型基于过去的几项研究成果:FlumeJava、Millwheel,适用场景包括 ETL、统计分析、实时计算等。目前,Beam 提供了两种语言的 SDK:Java、Python。本文将讲述如何使用 Python 编写 Beam 应用程序。

Apache Beam PipelineApache Beam Pipeline

安装 Apache Beam

Apache Beam Python SDK 必须使用 Python 2.7.x 版本,你可以安装 pyenv 来管理不同版本的 Python,或者直接从源代码编译安装(需要支持 SSL)。之后,你便可以在 Python 虚拟环境中安装 Beam SDK 了:

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$ virtualenv venv --distribute
$ source venv/bin/activate
(venv) $ pip install apache-beam

Wordcount 示例

Wordcount 是大数据领域的 Hello World,我们来看如何使用 Beam 实现:

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from __future__ import print_function
import apache_beam as beam
from apache_beam.options.pipeline_options import PipelineOptions
with beam.Pipeline(options=PipelineOptions()) as p:
lines = p | 'Create' >> beam.Create(['cat dog', 'snake cat', 'dog'])
counts = (
lines
| 'Split' >> (beam.FlatMap(lambda x: x.split(' '))
.with_output_types(unicode))
| 'PairWithOne' >> beam.Map(lambda x: (x, 1))
| 'GroupAndSum' >> beam.CombinePerKey(sum)
)
counts | 'Print' >> beam.ParDo(lambda (w, c): print('%s: %s' % (w, c)))

运行脚本,我们便可得到每个单词出现的次数:

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(venv) $ python wordcount.py
cat: 2
snake: 1
dog: 2

Apache Beam 有三个重要的基本概念:Pipeline、PCollection、以及 Transform。

  • Pipeline (管道)用以构建数据集和处理过程的 DAG(有向无环图)。我们可以将它看成 MapReduce 中的 Job 或是 Storm 的 Topology
  • PCollection 是一种数据结构,我们可以对其进行各类转换操作,如解析、过滤、聚合等。它和 Spark 中的 RDD 概念类似。
  • Transform (转换)则用于编写业务逻辑。通过它,我们可以将一个 PCollection 转换成另一个 PCollection。Beam 提供了许多内置的转换函数,我们将在下文讨论。

在本例中,Pipeline 和 PipelineOptions 用来创建一个管道。通过 with 关键字,上下文管理器会自动调用 Pipeline.run 和 wait_until_finish 方法。

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[Output PCollection] = [Input PCollection] | [Label] >> [Transform]

| 是 Beam 引入的新操作符,用来添加一个转换。每次转换都可以定义一个唯一的标签,默认由 Beam 自动生成。转换能够串联,我们可以构建出不同形态的转换流程,它们在运行时会表示为一个 DAG。

beam.Create 用来从内存数据创建出一个 PCollection,主要用于测试和演示。Beam 提供了多种内置的输入源(Source)和输出目标(Sink),可以接收和写入有界(Bounded)或无界(Unbounded)的数据,并且能进行自定义。

beam.Map 是一种 一对一 的转换,本例中我们将一个个单词转换成形如 (word, 1) 的元组。beam.FlatMap 则是 Map 和 Flatten 的结合体,通过它,我们将包含多个单词的数组合并成一个一维的数组。

CombinePerKey 的输入源是一系列的二元组(2-element tuple)。这个操作会将元素的第一个元素作为键进行分组,并将相同键的值(第二个元素)组成一个列表。最后,我们使用 beam.ParDo 输出统计结果。这个转换函数比较底层,我们会在下文详述。

输入与输出

目前,Beam Python SDK 对输入输出的支持十分有限。下表列出了现阶段支持的数据源(资料来源):

语言文件系统消息队列数据库JavaHDFS
TextIO
XMLAMQP
Kafka
JMSHive
Solr
JDBCPythontextio
avroio
tfrecordio-Google Big Query
Google Cloud Datastore

这段代码演示了如何使用 textio 对文本文件进行读写:

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lines = p | 'Read' >> beam.io.ReadFromText('/path/to/input-*.csv')
lines | 'Write' >> beam.io.WriteToText('/path/to/output', file_name_suffix='.csv')

通过使用通配符,textio 可以读取多个文件。我们还可以从不同的数据源中读取文件,并用 Flatten 方法将多个 PCollection 合并成一个。输出文件默认也会是多个,因为 Beam Pipeline 是并发执行的,不同的进程会写入独立的文件。

转换函数

Beam 中提供了基础和上层的转换函数。通常我们更偏向于使用上层函数,这样就可以将精力聚焦在实现业务逻辑上。下表列出了常用的上层转换函数:

转换函数功能含义Create(value)基于内存中的集合数据生成一个 PCollection。Filter(fn)使用 fn 函数过滤 PCollection 中的元素。Map(fn)使用 fn 函数做一对一的转换处理。FlatMap(fn)功能和 Map 类似,但是 fn 需要返回一个集合,里面包含零个或多个元素,最终 FlatMap 会将这些集合合并成一个 PCollection。Flatten()合并多个 PCollection。Partition(fn)将一个 PCollection 切分成多个分区。fn 可以是 PartitionFn 或一个普通函数,能够接受两个参数:elementnum_partitions。GroupByKey()输入源必须是使用二元组表示的键值对,该方法会按键进行分组,并返回一个 (key, iter<value>) 的序列。CoGroupByKey()对多个二元组 PCollection 按相同键进行合并,如输入的是 (k, v) 和 (k, w),则输出 (k, (iter<v>, iter<w>))。RemoveDuplicates()对 PCollection 的元素进行去重。CombinePerKey(fn)功能和 GroupByKey 类似,但会进一步使用 fn 对值列表进行合并。fn 可以是一个 CombineFn,或是一个普通函数,接收序列并返回结果,如 summax 函数等。CombineGlobally(fn)使用 fn 将整个 PCollection 合并计算成单个值。

Callable, DoFn, ParDo

可以看到,多数转换函数都会接收另一个函数(Callable)做为参数。在 Python 中,Callable 可以是一个函数、类方法、Lambda 表达式、或是任何包含 __call__ 方法的对象实例。Beam 会将这些函数包装成一个 DoFn 类,所有转换函数最终都会调用最基础的 ParDo 函数,并将 DoFn 传递给它。

我们可以尝试将 lambda x: x.split(' ') 这个表达式转换成 DoFn 类:

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class SplitFn(beam.DoFn):
def process(self, element):
return element.split(' ')
lines | beam.ParDo(SplitFn())

ParDo 转换和 FlatMap 的功能类似,只是它的 fn 参数必须是一个 DoFn。除了使用 return,我们还可以用 yield 语句来返回结果:

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class SplitAndPairWithOneFn(beam.DoFn):
def process(self, element):
for word in element.split(' '):
yield (word, 1)

合并函数

合并函数(CombineFn)用来将集合数据合并计算成单个值。我们既可以对整个 PCollection 做合并(CombineGlobally),也可以计算每个键的合并结果(CombinePerKey)。Beam 会将普通函数(Callable)包装成 CombineFn,这些函数需要接收一个集合,并返回单个结果。需要注意的是,Beam 会将计算过程分发到多台服务器上,合并函数会被多次调用来计算中间结果,因此需要满足交换律和结合律。summinmax 是符合这样的要求的。

Beam 提供了许多内置的合并函数,如计数、求平均值、排序等。以计数为例,下面两种写法都可以用来统计整个 PCollection 中元素的个数:

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lines | beam.combiners.Count.Globally()
lines | beam.CombineGlobally(beam.combiners.CountCombineFn())

其他合并函数可以参考 Python SDK 的官方文档(链接)。我们也可以自行实现合并函数,只需继承 CombineFn,并实现四个方法。我们以内置的 Mean 平均值合并函数的源码为例:

apache_beam/transforms/combiners.py

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class MeanCombineFn(core.CombineFn):
def create_accumulator(self):
"""创建一个“本地”的中间结果,记录合计值和记录数。"""
return (0, 0)
def add_input(self, (sum_, count), element):
"""处理新接收到的值。"""
return sum_ + element, count + 1
def merge_accumulators(self, accumulators):
"""合并多个中间结果。"""
sums, counts = zip(*accumulators)
return sum(sums), sum(counts)
def extract_output(self, (sum_, count)):
"""计算平均值。"""
if count == 0:
return float('NaN')
return sum_ / float(count)

复合转换函数

我们简单看一下上文中使用到的 beam.combiners.Count.Globally 的源码(链接),它继承了 PTransform 类,并在 expand方法中对 PCollection 应用了转换函数。这会形成一个小型的有向无环图,并合并到最终的 DAG 中。我们称其为复合转换函数,主要用于将相关的转换逻辑整合起来,便于理解和管理。

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class Count(object):
class Globally(ptransform.PTransform):
def expand(self, pcoll):
return pcoll | core.CombineGlobally(CountCombineFn())

更多内置的复合转换函数如下表所示:

复合转换函数功能含义Count.Globally()计算元素总数。Count.PerKey()计算每个键的元素数。Count.PerElement()计算每个元素出现的次数,类似 Wordcount。Mean.Globally()计算所有元素的平均值。Mean.PerKey()计算每个键的元素平均值。Top.Of(n, reverse)获取 PCollection 中最大或最小的 n 个元素,另有 Top.Largest(n), Top.Smallest(n).Top.PerKey(n, reverse)获取每个键的值列表中最大或最小的 n 个元素,另有 Top.LargestPerKey(n), Top.SmallestPerKey(n)Sample.FixedSizeGlobally(n)随机获取 n 个元素。Sample.FixedSizePerKey(n)随机获取每个键下的 n 个元素。ToList()将 PCollection 合并成一个列表。ToDict()将 PCollection 合并成一个哈希表,输入数据需要是二元组集合。

时间窗口

在处理事件数据时,如访问日志、用户点击流,每条数据都会有一个 事件时间 属性,而通常我们会按事件时间对数据进行分组统计,这些分组即时间窗口。在 Beam 中,我们可以定义不同的时间窗口类型,能够支持有界和无界数据。由于 Python SDK 暂时只支持有界数据,我们就以一个离线访问日志文件作为输入源,统计每个时间窗口的记录条数。对于无界数据,概念和处理流程也是类似的。

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64.242.88.10 - - [07/Mar/2004:16:05:49 -0800] "GET /edit HTTP/1.1" 401 12846
64.242.88.10 - - [07/Mar/2004:16:06:51 -0800] "GET /rdiff HTTP/1.1" 200 4523
64.242.88.10 - - [07/Mar/2004:16:10:02 -0800] "GET /hsdivision HTTP/1.1" 200 6291
64.242.88.10 - - [07/Mar/2004:16:11:58 -0800] "GET /view HTTP/1.1" 200 7352
64.242.88.10 - - [07/Mar/2004:16:20:55 -0800] "GET /view HTTP/1.1" 200 5253

logmining.py 的完整源码可以在 GitHub(链接)中找到:

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lines = p | 'Create' >> beam.io.ReadFromText('access.log')
windowed_counts = (
lines
| 'Timestamp' >> beam.Map(lambda x: beam.window.TimestampedValue(
x, extract_timestamp(x)))
| 'Window' >> beam.WindowInto(beam.window.SlidingWindows(600, 300))
| 'Count' >> (beam.CombineGlobally(beam.combiners.CountCombineFn())
.without_defaults())
)
windowed_counts = windowed_counts | beam.ParDo(PrintWindowFn())

首先,我们需要为每一条记录附加上时间戳。自定义函数 extract_timestamp 用以将日志中的时间 [07/Mar/2004:16:05:49 -0800] 转换成 Unix 时间戳,TimestampedValue 则会将这个时间戳和对应记录关联起来。之后,我们定义了一个大小为 10 分钟,间隔为 5 分钟 的滑动窗口(Sliding Window)。从零点开始,第一个窗口的范围是 [00:00, 00:10),第二个窗口的范围是 [00:05, 00:15),以此类推。所有窗口的长度都是 10 分钟,相邻两个窗口之间相隔 5 分钟。滑动窗口和固定窗口(Fixed Window)不同,因为相同的元素可能会落入不同的窗口中参与计算。最后,我们使用一个合并函数计算每个窗口中的记录数。通过这个方法得到前五条记录的计算结果为:

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[2004-03-08T00:00:00Z, 2004-03-08T00:10:00Z) @ 2
[2004-03-08T00:05:00Z, 2004-03-08T00:15:00Z) @ 4
[2004-03-08T00:10:00Z, 2004-03-08T00:20:00Z) @ 2
[2004-03-08T00:15:00Z, 2004-03-08T00:25:00Z) @ 1
[2004-03-08T00:20:00Z, 2004-03-08T00:30:00Z) @ 1

在无界数据的实时计算过程中,事件数据的接收顺序是不固定的,因此需要利用 Beam 的水位线和触发器机制来处理延迟数据(Late Data)。这个话题比较复杂,而且 Python SDK 尚未支持这些特性,感兴趣的读者可以参考 Stream 101 和 102 这两篇文章。

Pipeline 运行时

上文中提到,Apache Beam 是一个数据处理标准,只提供了 SDK 和 API,因而必须使用 Spark、Flink 这样的计算引擎来运行它。下表列出了当前支持 Beam Model 的引擎,以及他们的兼容程度:

Beam 运行时能力矩阵Beam 运行时能力矩阵

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