高通量数据

sra是NCBI 推出的存储高通量数据的格式，而平常我们工作用得多是fastq格式。如果需要把sra 转成fastq

http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?cmd=show&f=software&m=software&s=software，

直接下载sratoolkit.2.1.16-centos_linux64，解压就可以用sratoolkit.2.1.16-centos_linux64/bin/fastq-dump

然后使用如下命令行：

/data/safe/soft/sratoolkit.2.1.16-centos_linux64/bin/fastq-dump SRR034580.sra

这样就可以很简单的把sra格式转成fastq格式了。