使用`phy`进行神经网络数据读取及可视化之开发环境准备
来源:互联网 发布:java如何换行输出 编辑:程序博客网 时间:2024/06/18 17:53
基本步骤:
- 下载并安装
anaconda3
- 安装环境,environment.yml里面需要配置环境name和python版本:
conda env create -f environment.yml --force
- 安装phy和phycontrib,进入各自的目录执行:
python setup.py install
- 激活并进入环境:
activate phy-name
- 在新环境中安装phy和phycontrib:
pip install phy phycontrib
- 运行示例程序:
phy template-gui params.py
- 下载并安装
几个暂不知道具体原因的坑:
- 必须在激活环境之前,在
anaconda
操作环境下安装phy
和phycontrib
,否则会出现command not found
、supervisor module not found
等问题,这似乎是anaconda的一个BUG,如果没有在环境外面安装phy和phycontrib,在环境里面安装的这两个东西会认为目前的环境是Linux,所以出现只有在Linux下面才有的supervisor模块 - 使用
Anaconda2
可能会出现cli:39 unsupported pickle protocol: 3
这个错误,换成Anaconda3
就好了,python2.7
不支持这么高版本的协议,只能使用python3
phy template-gui
的示例数据打开后会生成.phy
目录,如果第一次打开失败,之后切换环境再次打开示例数据依然会失败,需要手动清除掉该目录,重新打开
- 必须在激活环境之前,在
链接:
- phy安装:https://pypi.python.org/pypi/phy
- phy-template-gui: http://phy-contrib.readthedocs.io/en/latest/template-gui/
- Anaconda下载:https://www.anaconda.com/download/#windows
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