python：13：第三方库的安装

第一章：python

第13节：第三方库的安装

1，模块的查找

Python模块的查找和下载；（网址）
pypi.python.org
Python内置模块的功能查看；（网址）
docs.python.org

2，模块的安装

Python第三方库的安装方法
Windows下的路径是：
C:\Python2.7\Lib\site-packages
（安装在D盘下的位置：D:\python2_7_14\Lib\site-packages）
Linux下的路径是：
Python-2.7.13/lib/python2.7/site-packages/

第三方库的管理器（pip和easy_insatll）
pip和easy_insatll作为Python第三方包的管理器，可以安装或卸载第三方库，其中pypi是一些python第三方库所在的源，使用pip或者easy_install安装模块，或搜索这个源，然后自动下载安装；
easy_install biopython或
pip install biopython

Windows版本的python其下载并安装python第三方库的具体方法

以NumPy 1.13.1为例，说明安装方法；
首先在PyPI当中的search处搜索numpy，在进入numpy 1.13.1页面后，在其中的File处选择：
numpy-1.13.1-cp27-none-win32.whl(md5.pgp)
点击md5可以下载一个文件名为：
numpy-1.13.1-cp27-none-win32.whl的文件
可以将文件放入桌面当中的一个文件夹内，并记住文件路径，例如：
C:\Users\lenovo\Desktop\python-install
在桌面开始处右键点击运行，在运行窗口内输入cmd，进入Doc页面
之后会在Doc页面显示当前位置C:\Users\lenovo>，输入cd Desktop\python_install
之后输入：pip install numpy-1.13.1-cp27-none-win32.whl
之后Doc页面会输出：
Processing C:\Users\lenovo\desktop\python_install\numpy-1.13.1-cp27-none-win32.whl
Installing callected packages: numpy
Sucessfully installed numpy-1.13.1

另一种下载安装第三方库的方法：
1，在pypi网站当中下载好压缩包之后放入一个指定的位置，例如桌面，解压压缩包之后，找到setup.py文件的路径
2，在运行窗口中输入cmd，进入Doc页面，然后移动到setup.py所在的目录，
3，之后输入python setup.py install进行安装
4，之后会显示安装结果，例如出现如下结果会表示安装成功：
Writing C:\Python27\Lib\site-packages\progressivecsv-0.0.0.2-py2.7.egg-info

第三种方法是利用pip install进行安装
1，同样在上面的doc运行页面，将目录移动到python安装的目录下的Scripts目录下（D:\python2_7_14\Scripts），因为该目录下存在pip.exe应用程序
2，在该目录下输入pip install加要输入的安装包的名称即可进行安装，以biopython为例说明安装方法
3，在该目录下输入pip install biopython -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/
4，输出内容为Collectig biopython
Downloading biopython-1.7.0.tar.gz (15.7MB)
有时会提示版本不兼容，需要windows的C++版本更高级别，所以可以推荐源码安装
报错信息为：
error: Microsoft Visual C++ 9.0 is required. Get it from http://aka.ms/vcpython27

linux版本的python其下载并安装python第三方库的具体方法

设定安装包的packages路径：
在自己目录下的.bashrc文件（~/.bashrc）当中加入如下内容：

export PYTHONPATH='/home/D00/anaconda2/lib/python2.7/site-packages:/home/D00/language/Python-2.7.13/lib/python2.7/site-packages:/ho
me/D00/language/Python-3.6.2/Lib/site-packages'

1，首先，在安装第三方库之前，先要安装easy_install和pip
2，获得easy_install的地址：
https://pypi.python.org/pypi/ez_setup进入网页后
点击 Download
将下载的包，放入python安装目录当中的Lib/site-packages中
之后输入如下命令：
tar zxvf ez_setup-0.9.tar.gz
cd ez_setup-0.9
python ez_setup.py #（如果python安装好后，可以将安装的bin目录加入到~/.bashrc文件内，加入到环境变量中，如果没有加入环境变量需要用全路径调用python）
3，安装easy_install，输入：
python distribute_setup.py install
之后会在Python-2.7.13/bin目录下产生两个文件，easy_install和easy_install-2.7
之后在这个bin目录下再输入如下命令可以实现pip的安装
./easy_install2.7 pip -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/
4，如果安装失败可尝试手动下载并安装pip
下载pip的地址：
https://pypi.python.org/pypi/pip/9.0.1#downloads
点击下载，放入Lib/site-packages目录当中
之后输入如下命令：
tar zxvf pip-9.0.1.tar.gz
python setup.py install
（但要在安装easyinstall之后再安装pip，from setuptools import setup, find-packages）
5，利用 pip install安装第三方包
在Python-2.7.13/bin目录下输入如下命令可进行安装：
./pip2.7 install biopython -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/
./pip2.7 install mysql -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/
numpy pandas matplotlib pysam等
6，pip的版本升级
./pip2.7 install --upgrade pip