安装ViennaRNA的perl模块

来源:互联网 发布:jdk源码分析书籍 编辑:程序博客网 时间:2024/05/29 13:49
这两天安装ViennaRNA的perl模块(在interface的perl目录)时着实遇到了很大的问题。
首先运行(./configure)的功能(不要指定--prefix,否则会与cpan中指定的路径冲突):
$ perl Makefile.PL
输出如下内容:
Generating a Unix-style Makefile.perl
Writing Makefile.perl for RNA
Writing MYMETA.yml and MYMETA.json
开始没注意,蒙着头继续make,结果输出错误:
make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.
证明缺少makefile。
折腾了很久,回头才发现,上行命令产生的Makefile.perl就是需要的makefile,于是为make指定makefile:
$ make -f Makefile.perl
这才没有输出错误。接下来继续安装:
$ make -f Makefile.perl install
最后貌似成功了,安装到了local::lib指定的目录中了:
Installing /home/yanmk/perl5/lib/perl5/x86_64-linux-thread-multi/auto/RNA/RNA.so
Installing /home/yanmk/perl5/lib/perl5/x86_64-linux-thread-multi/RNA.pm
Installing /home/yanmk/perl5/man/man3/RNA.3pm
Appending installation info to /home/yanmk/perl5/lib/perl5/x86_64-linux-thread-multi/perllocal.pod

添加lib到mireap的指定lib:
$ export PERL5LIB=$PERL5LIB:/home/yanmk/perl5/lib/perl5/x86_64-linux-thread-multi/