神经网络模拟器Brian2的安装

官方指南：brian2.readthedocs.io/en/stable/introduction/install.html 或 http://briansimulator.org/

系统环境： ubuntu 16.04

依赖： Python 2.7

安装工具： pip

安装路线：

1. 从source安装Brain2

    sudo pip intall brain2

    (如果没有pip, apt-get intall -y python-pip)

    成功安装 brian2-2.1.2 mpmath-1.0.0 py-cpuinfo-3.3.0 sympy-1.1.1

2. 安装辅助工具包

    matplotlib (for plotting);

    nose (for running the testsuite);

     ipython

     jupyter-notebook (for an interactive console)

    安装jupyter遇到问题，看官网指导“http://jupyter.org/install.html”

3.  安装Brain2tool(用于模拟结果的可视化)

    sudo pip install brian2tools

    成功安装 brian2tools-0.2.1.1 pylems-0.4.9 setuptools-scm-1.15.6

4. 安装cython(写Cpython，优化计算)

    sudo -H pip install cython

5. 测试

    python

    import brian2

    brain.test()

    无警告无错误就说明安装成功，有skip可以。

    在我的安装过程中出现了GSL头文件缺失的问题，以及“warning: command line option ‘-Wstrict-prototypes’ is valid for C/ObjC but not for C++”警告，

    重新安装GSL库即可，命令如下：

    sudo apt-get install libgsl0-dev

    GSL(GNU Scientific Library)作为三大科学计算库之一，除了涵盖基本的线性代数，微分方程，积分，随机数，组合数，方程求根，多项式求根，排序等，

    还有模拟退火，快速傅里叶变换，小波，插值，基本样条，最小二乘拟合，特殊函数等(具体参考：www.cnblogs.com/nju2014/p/5334928.html)