Find Patterns Forming Clumps in a String

来源:互联网 发布:感情网络用语有哪些? 编辑:程序博客网 时间:2024/06/18 09:41

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解决这种问题首先要理解题目的意思,这道题的意思就是说首先将给定的字符串每L长度为一个字串,然后在这个子串中查找k-mer,k-mer在该子串出现的次数要大于等于t次,输出结果的时候,再将每个L长度的子串中重复的项去掉就可以了。
代码:

@author YJCdna = input()data = list(map(int, input().split()))k, L, t = data[0], data[1], data[2]result=[]for i in range(len(dna) - L + 1):#将给定的串分成L长度的子串    d = {}        for j in range(i, i + L):#用字典统计每个子串出现的次数        if dna[j:j + k] not in d.keys():            d[dna[j:j + k]] = 1        else:            d[dna[j:j + k]] += 1    for i in d.keys():        if d[i] >= t and i not in result:#在结果中去掉重复的k-mer            result.append(i)            print(i,end=" ")
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