POJ3294 Life Forms 【后缀数组】

来源:互联网 发布:linux snmp v3 编辑:程序博客网 时间:2024/05/19 19:57

生命形式
时间限制: 5000MS 内存限制: 65536K提交总数: 16660 接受: 4910

描述

你可能想知道为什么大多数外星人的生命形式与人类相似,不同的是表面特征,如身高,肤色,皱纹,耳朵,眉毛等等。有几个没有人类的相似之处; 这些通常具有几何形状或无定形形状,如立方体,浮油或灰尘云。

“ 星际迷航 ”第146集“ The Chase ” 给出了答案事实证明,在这个象限的绝大多数生命形式中,共同DNA的一大片段结束了。

考虑到以字母串表示的几种生命形式的DNA序列,你应该找到一半以上的共享时间最长的子串。

输入

标准输入包含几个测试用例。每个测试用例始于1≤ Ñ ≤100,生命形式的数目。n行跟随; 每个都包含一串小写字母,代表生命形式的DNA序列。每个DNA序列包含至少一个但不超过1000个字母。最后一个测试用例后面是一行。

产量

对于每个测试用例,输出一半以上生命形式共享的最长的字符串或字符串。如果有多个,按字母顺序输出。如果至少有一个字母没有解决方案,输出“?”。在测试用例之间留下一条空行。

示例输入

3ABCDEFGbcdefghcdefghi3XXXYYYZZZ0

示例输出

bcdefgcdefgh

类似双串匹配,我们将所有串通过一个间隔符链接起来,但要注意使用不同的间隔符,否则可能会将间隔符加入匹配【与双串不同,因为双串只有一个间隔符,无论如何也不会参与匹配】

之后我们常规二分答案,对于给定长度len,看看能否找到连续height都>=len且出现过的串的个数 >= N/2

最后我们得到ans,再进行一次查询,这次一找到直接输出


方法还是很直白,~~只是要考虑特判N = 1~~【不然会全部输出,直接OLE  QAQ】

#include<iostream>#include<cstdio>#include<cstring>#include<algorithm>#define LL long long int#define REP(i,n) for (int i = 1; i <= (n); i++)#define Redge(u) for (int k = head[u]; k != -1; k = edge[k].next)using namespace std;const int maxn = 100200,maxm = 100005,INF = 1000000000;inline int RD(){int out = 0,flag = 1; char c = getchar();while (c < 48 || c > 57) {if (c == '-') flag = -1; c = getchar();}while (c >= 48 && c <= 57) {out = (out << 1) + (out << 3) + c - '0'; c = getchar();}return out * flag;}char s[maxn],A[maxn];int sa[maxn],rank[maxn],height[maxn],t1[maxn],t2[maxn],c[maxn],n,m,N,vis[105];int id[maxn],len[maxn],Max;void SA(){int *x = t1,*y = t2;for (int i = 0; i <= m; i++) c[i] = 0;for (int i = 1; i <= n; i++) c[x[i] = s[i]]++;for (int i = 1; i <= m; i++) c[i] += c[i - 1];for (int i = n; i >= 1; i--) sa[c[x[i]]--] = i;for (int k = 1; k <= n; k <<= 1){int p = 0;for (int i = n - k + 1; i <= n; i++) y[++p] = i;for (int i = 1; i <= n; i++) if (sa[i] - k > 0) y[++p] = sa[i] - k;for (int i = 0; i <= m; i++) c[i] = 0;for (int i = 1; i <= n; i++) c[x[y[i]]]++;for (int i = 1; i <= m; i++) c[i] += c[i - 1];for (int i = n; i >= 1; i--) sa[c[x[y[i]]]--] = y[i];swap(x,y);p = 1; x[sa[1]] = 1;for (int i = 2; i <= n; i++)x[sa[i]] = (y[sa[i]] == y[sa[i - 1]] && y[sa[i] + k] == y[sa[i - 1] + k]) ? p : ++p;if (p >= n) break;m = p;}for (int i = 1; i <= n; i++) rank[sa[i]] = i;int k = 0;for (int i = 1; i <= n; i++){if (k) k--;int j = sa[rank[i] - 1];while (s[i + k] == s[j + k]) k++;height[rank[i]] = k;}}bool check(int K){memset(vis,-1,sizeof(vis));int flag = 0,cnt = 0;for (int i = 1; i <= n; i++){if (id[sa[i]] == -1){flag++; cnt = 1; continue;}if (height[i] < K) cnt = 1,vis[id[sa[i]]] = ++flag;else {if (vis[id[sa[i]]] != flag) ++cnt; vis[id[sa[i]]] = flag;}if (cnt > N / 2) return true;}return false;}void getans(int K){//cout<<K<<endl;memset(vis,-1,sizeof(vis));int flag = 0,cnt = 0,pos = sa[1],ok = true;for (int i = 1; i <= n; i++){if (id[sa[i]] == -1){flag++; cnt = 1; ok = true; pos = sa[i]; continue;}if (height[i] < K) cnt = 1,vis[id[sa[i]]] = ++flag,ok = true,pos = sa[i];else {if (vis[id[sa[i]]] != flag) ++cnt; vis[id[sa[i]]] = flag;}if (cnt * 2 > N && ok){ok = false;for (int j = 0; j < K; j++) putchar(s[pos + j]);puts("");}}}void solve(){int l = 0,r = Max,mid;while (l < r){mid = l + r + 1 >> 1;if (check(mid)) l = mid;else r = mid - 1;}if (!l) printf("?\n");else getans(l);printf("\n");}int main(){while ((N = RD())){if (N == 1){scanf("%s",s + 1);printf("%s\n\n",s + 1);continue;}s[1] = '\0'; n = 0; m = 256; Max = -INF;int tem,C = 0;REP(i,N){scanf("%s",A); tem = strlen(A); len[i] = n + tem; Max = max(Max,tem);for (int j = 1; j <= tem; j++) id[n + j] = i; id[n + tem + 1] = -1;strcat(s + 1,A); A[0] = ++C; A[1] = '\0'; strcat(s + 1,A);n += tem + 1;}//REP(i,n) cout<<id[i];cout<<endl;SA();//for (int i = 2; i <= n; i++) cout<<height[i]<<' ';cout<<endl;solve();}return 0;}


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