Ubuntu 10.04下MPICH2配置详解

来源：互联网发布：爱知重庆编辑：程序博客网时间：2024/04/29 08:54

1。在所有节点配置主机名：sudo gedit /etc/hosts

192.168.100.100 stanford-desktop //这是我的主结点
192.168.100.200 client-desktop
192.168.100.230 server-desktop

2. 安装NFS文件系统和共享目录

在终端窗口输入如下命令：

sudo apt-get install nfs-kernel-server

安装完成之后，可以使用在终端窗口下输入：

sudo mkdir /mirror

该命令会在根目录下创建一个/mirror的目录，该目录就是今后所有节点共享的目录，稍后我们会将MPICH2安装在该目录下，同时可以设置所有节点已启动便挂在该目录，这样，我们可以只在主节点上安装一次MPICH即可。

接下来需要修改该目录所属的用户及组，使用ls –l命令可以看到，刚才创建的/mirror目录属于root用户，需要将它的用户和组改为stanford。使用如下命令更改用户和组：

sudo chown stanford:stanford /mirror

注意：在给每个节点安装系统发的时候，请提供一个统一的用户名及密码，此文中使用stanford为统一用户名。方便之后的配置。

接着，我们需要对NFS sever做一些配置。sudo gedit /etc/exports

/mirror client-desktop(rw,sync)
/mirror server-desktop(rw,sync)

安装过程中如有需要可以使用sudo /etc/init.d/nfs-kernel-server restart命令来重启NFS服务。

3. ssh无密码互通

   3.1.确认ssh可以运行
       3.1.1. 修改sshd_config文件：sudo gedit /etc/ssh/sshd_config
       3.1.2. 将#PasswordAuthentication no中的#去掉
       3.1.3. 重新启动SSH服务，命令为：/etc/init.d/sshd restart
       3.1.4. 验证SSH服务状态，命令为：/etc/init.d/sshd status

3.2. 设置stanford-desktop
    3.2.1 生成ssh密钥对:ssh-keygen -t rsa 一路回车即可.
    3.2.2 查看是否有.ssh文件夹:ls -a
      3.2.3 进入.ssh目录:cd .ssh
    3.2.4 生成authorized_keys文件:cp id_rsa.pub authorized_keys
    3.2.5 建立本身的信任连接:ssh stanford-desktop 输入yes 无需密码

3.3.设置client-desktop
     3.3.1 生成ssh密钥对：ssh-keygen -t dsa （dsa与stanford-desktop的rsa设置不要相同）
   3.3.2 进入.ssh目录:cd .ssh
     3.3.3 生成authorized_keys文件:cp id_dsa.pub authorized_keys
   3.3.4 建立本身的信任连接:ssh client-desktop 输入yes 无需密码

3.4.设置server-desktop的方法与stanford-desktop,client-desktop相同

3.5.关键步骤
    3.5.1 将client-desktop，server-desktop的authorized_keys内容追加至stanford-desktop的authorized_keys文件中。
    3.5.1.1 client-desktop： cat authorized_keys 复制内容
    3.5.1.2 stanford-desktop： gedit authorized_keys 在最末行添加复制。
          server-desktop 同上述操作相同
    3.5.2 将以追加的文件authorized_keys覆盖client-desktop，server-desktop上的authorized_keys文件。
    3.5.2.1 登陆client-desktop：scp stanford-desktop:~/.ssh/authorized_keys ~.ssh/authorized_keys
   3.5.2.2 登陆server-desktop：scp stanford-desktop:~/.ssh/authorized_keys ~ /.ssh/authorized_keys

3.6.确认机器的信任连接已建立
3.6.1 对每台机器执行：ssh stanford-desktop; ssh client-desktop; ssh server-desktop在提示处输入yes回车。

4. 安装MPICH2

首先安装GCC，在终端输入如下命令：

sudo apt-get install build-essential

sudo apt-get install autoconf

sudo apt-get install automake

下载MPICH2源码包

cd /mirror

mkidr mpich2

tar xvf mpich2-1.0.5p3.tar.gz

cd mpich2-1.0.5p3

./configure --prefix=/mirror/mpich2

make

sudo make install

接下来需要做的是配置环境变量，使用gedit ~/.bashrc，在文件末尾添加如下语句(每个节点下都配置)：

export PATH="$PATH:/mirror/mpich2/bin"
export PATH
export LD_LIBRARY_PATH="/mirror/mpich2/lib:$LD_LIBRARY_PATH"
export LD_LIBRARY_PATH

接着需要配置/etc/environment文件使ssh能够找到MPICH2的安装目录。使用sudo gedit /etc/environment，在PATH环境变量中添加/mirror/mpich2/bin(每个节点下都配置)

PATH="/mirror/mpich2/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games"

5. mpd配置

首先，在stanford-desktop的家目录下创建mpd.hosts文件，命令如下：

gedit ~/mpd.hosts

接着，将所有节点的IP写入

192.168.100.100
192.168.100.200
192.168.100.230

保存退出。接着需要配置~/.mpd.conf文件，使用如下命令：

gedit ~/.mpd.conf

在文件中写入如下语句(最好每个节点下都配置)：

secretword=something #something为任意字符串，所有节点都要设置相同的字符串

保存退出，接着，需要将~/.mpd.conf文件的权限设置为600，使用如下命令：

touch ～/.mpd.conf

chmod 600 ~/.mpd.conf

至此，MPD的配置工作完成。用户可以使用mpd &,mpdtrace和mpdallexit测试MPICH2是否正常工作。

6. 客户端配置

在每一个节点都需要安装nfs客户端与ssh，安装过程与主节点类似。使用如下命令：

sudo apt-get install nfs-kernel-server #或者nfs-common

sudo apt-get install openssh-server openssh-client

对于SSH，请参见主节点SSH配置一节的操作，如果配置成功，各节点之间访问应该都不需要密码。如果失败，可以重复生成私钥和公钥以及拷贝的操作。

对于NFS，客户节点需要做自动挂载主节点的/mirror目录。使用vi打开各节点的/etc/fstab文件，在文件末尾添加：

stanford-desktop:/mirror /mirror nfs rw, async, auto, exec, nouser, suid 0 0

7. 如果出现问题可以试试关闭防火墙

sudo iptables –P INPUT ACCEPT

sudo iptables –P OUTPUT ACCEPT

sudo ufw disable

参考：http://blog.chinaunix.net/u3/104586/showart_2090851.html

http://night85.blog.51cto.com/231209/280995