linux mpich2 配置

 Linux下MPI的环境配置还真是有些复杂，通过查资料和自己摸索，终于搞定了，现总结如下，以免以后忘记。（只作备忘之用，无通用性）

　　（一）安装MPICH2

　　安装包可去MPICH2的主页下载，我下载的是MPICH2-1.2.1.tar.gz，放在/home/hadoop下

　　1、解压缩 tar -xzvf mpich2-1.2.1.tar.gz 得到mpich2-1.2.1文件夹

　　2、进入mpich2-1.2.1：cd mpich2-1.2.1

　　3、安装：

　　　　(1) ./configure --prefix=/home/hadoop/mpich2

　　　　如果提示缺少什么软件，就sudo apt-get install 所缺软件名

　　　　(2) make

　　　　(3) make install

　　4、安装完毕后，配置环境变量

　　　　export PATH=/home/hadoop/mpich2/bin:$PATH

　　　　测试：

　　　　　　which mpd

　　　　　　which mpicc

　　　　　　which mpirun

　　　　正确安装的结果为 /home/hadoop/mpich2/bin/ +（mpd, mpicc, mpirun ）

 

　　（二）单机测试

　　1、运行程序之前配置进程管理器MPD

　　　　　cd $HOME

　　　　　touch .mpd.conf

　　　　　chmod 600 .mpd.conf

　　　　　vi .mpd.conf 加入一行：secretword=[自定的密码]

　　2、启动MPD

　　　　　MPD &

　　3、编译程序　　

　　　　　mpicc program_name.c -o program_name.out

　　4、运行

　　　　　mpirun -n 4 ./program_name.out

　　5、结束MPD

　　　　    mpdallexit

 

　　（三）多机测试

　　1、建立ssh信任

　　　　sudo vi /etc/hosts

　　　　加入参与运算的主机IP，可以为每个IP起别名，如

　　　　196.168.1.123   node1

　　　　返回主目录

　　　　ssh-keygen -t rsa

　　　　生成.ssh文件夹，其中，id_rsa为私钥，id_rsa.pub为公钥

　　　　scp ~/.ssh/id_rsa.pub hadoop@59.67.33.163:.ssh/id_rsa.pub0　

　　　　（复制到另一方需重命名，防止覆盖原来机器的公钥）

　　　　然后ssh到slave一方，将公钥加到authorized_keys中：

　　　　cat .ssh/id_ras.pub0 >> .ssh/authorized_keys

　　　　之后便可 ssh hadoop@59.67.33.163 连接到服务器，无需密码

　　　　设置/etc/hosts，~/mpd.hosts无需再说

　　　　之后就可用mpdboot命令在集群上跑程序了。

　　　　　　

　　　注：当配置有问题的时候，有几个方法查看，首先是mpdcheck。mpdcheck -pc可获得一些本机的信息。mpdcheck -l差错。mpdcheck -f mpd.hosts可以查看文件错误。其次，在mpdboot过程中可以加入 -d -v 可以debug和查看过程