hadoop 集群优化1

 

1. 概述

随着企业要处理的数据量越来越大，MapReduce思想越来越受到重视。Hadoop是MapReduce的一个开源实现，由于其良好的扩展性和容错性，已得到越来越广泛的应用。Hadoop作为一个基础数据处理平台，虽然其应用价值已得到大家认可，但仍存在很多问题，以下是主要几个：

（1） Namenode/jobtracker单点故障。 Hadoop采用的是master/slaves架构，该架构管理起来比较简单，但存在致命的单点故障和空间容量不足等缺点，这已经严重影响了Hadoop的可扩展性。

（2） HDFS小文件问题。在HDFS中，任何block，文件或者目录在内存中均以对象的形式存储，每个对象约占150byte，如果有1000 0000个小文件，每个文件占用一个block，则namenode需要2G空间。如果存储1亿个文件，则namenode需要20G空间。这样namenode内存容量严重制约了集群的扩展。

（3） jobtracker同时进行监控和调度，负载过大。为了解决该问题，yahoo已经开始着手设计下一代Hadoop MapReduce（见参考资料1）。他们的主要思路是将监控和调度分离，独立出一个专门的组件进行监控，而jobtracker只负责总体调度，至于局部调度，交给作业所在的client。

（4） 数据处理性能。 很多实验表明，其处理性能有很大的提升空间。Hadoop类似于数据库，可能需要专门的优化工程师根据实际的应用需要对Hadoop进行调优，有人称之为“Hadoop Performance Optimization” (HPO)。

为了提高其数据性能，很多人开始优化Hadoop。总结看来，对于Hadoop，当前主要有几个优化思路：

（1） 从应用程序角度进行优化。由于mapreduce是迭代逐行解析数据文件的，怎样在迭代的情况下，编写高效率的应用程序，是一种优化思路。

（2） 对Hadoop参数进行调优。当前hadoop系统有190多个配置参数，怎样调整这些参数，使hadoop作业运行尽可能的快，也是一种优化思路。

（3） 从系统实现角度进行优化。这种优化难度是最大的，它是从hadoop实现机制角度，发现当前Hadoop设计和实现上的缺点，然后进行源码级地修改。该方法虽难度大，但往往效果明显。

以上三种思路出发点均是提高hadoop应用程序的效率。实际上，随着社会的发展，绿色环保观念也越来越多地融入了企业，因而很多人开始研究Green Hadoop，即怎样让Hadoop完成相应数据处理任务的同时，使用最少的能源（见参考资料[14][15]）。

本文主要介绍了当前学术界的一些优化思路，有人试图从Hadoop自动配置角度对Hadoop进行优化，但更多的是从系统实现角度进行优化，概括其优化点和实验效果如下：

（1） 论文[6]试图从参数自动调优角度对Hadoop进行优化，论文只给出了可能的解决方案，并未给出实现，因而效果不可知。但它给出了一种Hadoop优化的新思路，即怎样对其190多个配置参数进行自动调整，使应用程序执行效率最高。

（2） 论文[7]提出prefetching和preshuffling机制，在不同负载不同规模集群下测试，效率提升了约73%。

（3） 论文[8]研究了影响Hadoop效率的五个因素，并通过提出相应的解决方案，使Hadoop效率提高了2.5~3.5倍。

（4） 论文[9]为Hadoop提供了一种索引机制– Trojan Index，同时提出了一种高效的join算法– Trojan Join，实验表明，效率比Hadoop和HadoopDB高很多。

除了学术界的优化，工业界也在不断进行优化以适应自己公司的产品需要，主要有：

（1）Baidu公司。baidu对Hadoop中关键组件使用C++进行了重写（包括map, shuffler和reducer等），经他们内部测试（5 nodes，40GB data），效率提升了约20%（见参考资料[4]）。

（2）淘宝。淘宝针对自己集群特点（作业小，slot多，作业之间有依赖，集群共享，有些作业有时效性），对jobtracker和namenode进行了优化，据其官方博客称，其jobtracker有较大性能提升，且namenode吞吐量提升了8+倍（见参考资料[5]）。但其具体优化方法，未公开。

2. 从应用程序角度进行优化

（1） 避免不必要的reduce任务

如果要处理的数据是排序且已经分区的，或者对于一份数据, 需要多次处理, 可以先排序分区；然后自定义InputSplit, 将单个分区作为单个mapred的输入；在map中处理数据, Reducer设置为空。

这样, 既重用了已有的 “排序”, 也避免了多余的reduce任务。

（2）外部文件引入

有些应用程序要使用外部文件，如字典，配置文件等，这些文件需要在所有task之间共享，可以放到分布式缓存DistributedCache中（或直接采用-files选项，机制相同）。

更多的这方面的优化方法，还需要在实践中不断积累。

（3） 为job添加一个Combiner

为job添加一个combiner可以大大减少shuffle阶段从map task拷贝给远程reduce task的数据量。一般而言，combiner与reducer相同。

（4） 根据处理数据特征使用最适合和简洁的Writable类型

Text对象使用起来很方便，但它在由数值转换到文本或是由UTF8字符串转换到文本时都是低效的，且会消耗大量的CPU时间。当处理那些非文本的数据时，可以使用二进制的Writable类型，如IntWritable， FloatWritable等。二进制writable好处：避免文件转换的消耗；使map task中间结果占用更少的空间。

（5） 重用Writable类型

很多MapReduce用户常犯的一个错误是，在一个map/reduce方法中为每个输出都创建Writable对象。例如，你的Wordcout mapper方法可能这样写：

public void map(...) {  …  for (String word : words) {    output.collect(new Text(word), new IntWritable(1));  }}

这样会导致程序分配出成千上万个短周期的对象。Java垃圾收集器就要为此做很多的工作。更有效的写法是：

class MyMapper … {  Text wordText = new Text();  IntWritable one = new IntWritable(1);  public void map(...) {    for (String word: words) {      wordText.set(word);      output.collect(wordText, one);    }  }}

（6） 使用StringBuffer而不是String

当需要对字符串进行操作时，使用StringBuffer而不是String，String是read-only的，如果对它进行修改，会产生临时对象，而StringBuffer是可修改的，不会产生临时对象。

（7）调试

最重要，也是最基本的，是要掌握MapReduce程序调试方法，跟踪程序的瓶颈。具体可参考：

http://www.cloudera.com/blog/2009/12/7-tips-for-improving-mapreduce-performance/

3. 对参数进行调优

3.1 参数自动调优

论文[6]试图从自动化参数调优角度对hadoop应用程序运行效率进行优化。Hadoop目前有190多个配置参数，其中大约有25个对hadoop应用程序效率有显著的影响。

论文首先分析了database优化思路。Database会根据用户输入的SQL建立一个代价模型：，其中y表示查询q优化目标（如运行时间），p表示q的查询计划，r表示为执行计划p而申请的资源量，d表示一些统计信息。数据库会根据该代价模型评估不同的查询计划，并选择一个最优的执行查询。这种数据库模型很难扩展应用到mapreduce环境中，主要是因为：

（1） mapreduce作业一般是采用C，C++或java编写，与声明性语言SQL有明显不同。

（2） 缺少有关输入数据的统计信息。Mapreduce作业通常是运行时解析动态输入文件的，因而运行之前schema或者统计信息均是未知的。

（3） 它们的优化空间不同。数据库的查询优化空间（主要是选择最优的plan）与mapreduce的优化空间（主要是配置参数调优）不同。

本论文提出了三种可行的方案，第一种是基于采样的方法，借鉴Terasort作业的思路，先对输入数据进行采样，然后通过样本估算不同配置下作业的执行时间，最后选择一种最优的配置。该方法需要解决的一个问题是，由于reduce阶段和map阶段存在数据依赖，因而map完成之前，reduce的所有信息均是未知的。有一种也是可行的思路是，执行作业之前，先采样选择一个样本组成一个小作业，然后执行该小作业以估算大作业性能。该方法也存在一个需要解决的问题，怎样采样才能使样本最能代表总体？

第二种是Late Binding，即延迟绑定，其思想是延迟设置其中的一个或多个参数，直到job已经部分执行，且这些参数可以确定。比如hadoop中的combiner操作实际就是采用的这一机制，作业在执行完map()之前不知道要不要进行combine。

第三种是Competition-based Approaches，其思想是，首先，同时执行多个配置有不同参数的task，然后，尽快决定哪种配置的task执行速度快，最后，杀掉其它task。

该文章完全是个调研性的论文，它先研究了数据库的一些调优方法，经过研究发现不可以直接将这些方法应用于mapreduce系统中，进而针对mapreduce独有的特点，提出了几种也许可行的方法，但论文中并未给出实现。

3.2 参数手工配置

3.2.1 Linux文件系统参数调整

（1） noatime 和 nodiratime属性

文件挂载时设置这两个属性可以明显提高性能。。默认情况下，Linux ext2/ext3 文件系统在文件被访问、创建、修改时会记录下文件的时间戳，比如：文件创建时间、最近一次修改时间和最近一次访问时间。如果系统运行时要访问大量文件，关闭这些操作，可提升文件系统的性能。Linux 提供了 noatime 这个参数来禁止记录最近一次访问时间戳。

（2） readahead buffer

调整linux文件系统中预读缓冲区地大小，可以明显提高顺序读文件的性能。默认buffer大小为256 sectors，可以增大为1024或者2408 sectors（注意，并不是越大越好）。可使用blockdev命令进行调整。

（3） 避免RAID和LVM操作

避免在TaskTracker和DataNode的机器上执行RAID和LVM操作，这通常会降低性能。

3.2.2 Hadoop通用参数调整

（1） dfs.namenode.handler.count或mapred.job.tracker.handler.count

namenode或者jobtracker中用于处理RPC的线程数，默认是10，较大集群，可调大些，比如64。

（2） dfs.datanode.handler.count

datanode上用于处理RPC的线程数。默认为3，较大集群，可适当调大些，比如8。需要注意的是，每添加一个线程，需要的内存增加。

（3） tasktracker.http.threads

HTTP server上的线程数。运行在每个TaskTracker上，用于处理map task输出。大集群，可以将其设为40~50。

3.2.3 HDFS相关配置

（1） dfs.replication

文件副本数，通常设为3，不推荐修改。

（2） dfs.block.size

HDFS中数据block大小，默认为64M，对于较大集群，可设为128MB或者256MB。（也可以通过参数mapred.min.split.size配置）

（3） mapred.local.dir和dfs.data.dir

这两个参数mapred.local.dir和dfs.data.dir 配置的值应当是分布在各个磁盘上目录，这样可以充分利用节点的IO读写能力。运行 Linux sysstat包下的iostat -dx 5命令可以让每个磁盘都显示它的利用率。

3.2.4 map/reduce 相关配置

（1） {map/reduce}.tasks.maximum

同时运行在TaskTracker上的最大map/reduce task数，一般设为(core_per_node)/2~2*（cores_per_node）。

（2） io.sort.factor

当一个map task执行完之后，本地磁盘上(mapred.local.dir)有若干个spill文件，map task最后做的一件事就是执行merge sort，把这些spill文件合成一个文件（partition）。执行merge sort的时候，每次同时打开多少个spill文件由该参数决定。打开的文件越多，不一定merge sort就越快，所以要根据数据情况适当的调整。

（3） mapred.child.java.opts

设置JVM堆的最大可用内存，需从应用程序角度进行配置。

3.2.5 map task相关配置

（1） io.sort.mb

Map task的输出结果和元数据在内存中所占的buffer总大小。默认为100M，对于大集群，可设为200M。当buffer达到一定阈值，会启动一个后台线程来对buffer的内容进行排序，然后写入本地磁盘(一个spill文件)。

（2） io.sort.spill.percent

这个值就是上述buffer的阈值，默认是0.8，即80%，当buffer中的数据达到这个阈值，后台线程会起来对buffer中已有的数据进行排序，然后写入磁盘。

（3） io.sort.record

Io.sort.mb中分配给元数据的内存百分比，默认是0.05。这个需要根据应用程序进行调整。

（4） mapred.compress.map.output/ Mapred.output.compress

中间结果和最终结果是否要进行压缩，如果是，指定压缩方式（Mapred.compress.map.output.codec/ Mapred.output.compress.codec）。推荐使用LZO压缩。Intel内部测试表明，相比未压缩，使用LZO压缩的TeraSort作业运行时间减少60%，且明显快于Zlib压缩。

3.2.6 reduce task相关配置

（1） Mapred.reduce.parallel

Reduce shuffle阶段copier线程数。默认是5，对于较大集群，可调整为16~25。