批量提交Bsub命令

来源：互联网发布：数据恢复精灵离线激活编辑：程序博客网时间：2024/06/05 05:19

1. 创建脚本如 a.sh，内容：

#!/bin/bashfor ((i=1; i<=58; i++))do        bsub -q serial -e temp$i.err -o temp$i.log "./regex -p temp$i --m --i"done

2. 修改权限

chmod u+x a.sh

3. 执行 ./a.sh
4. 得到一系列结果文件，根据结果中的某行“final size: ”进行排序，使用shell文件 b.sh，内容如下：

#!/bin/bashfor ((i=1; i<=58; i++))doecho -n $i " " ; grep "final size" temp$i.err done

执行./b.sh： ./b.sh> entries

5. 接下来根据entries中的第四列进行排序：

sort -n -k 4 entries | awk "{printf $1, $4}" > sorted_entries

6. 根据排序后的文件跑程序，建立 c.sh ，内容如下：

list=(9 14 39 44 45 16 28 3 7 21 42 38 22 54 4 32 33 23 37 10 30 5 41 35 36 40 43 19 11 31 34 51 53 18 55 58 8 15 20 56 29 6 48 47 57 46 49 52 13 1 26 25 27 2 12 24 50 17)for ((i=2; i<=58; i++))doprintf "bsub -q serial -e ttrend_$i.err -o ttrend_$i.log \"./regex -pm $i "for ((j=0; j<$i; j++))doprintf "temp%d " "${list[$j]}" doneprintf " --m --i\";"echodone

list是排好序的文件名。

7. 执行c.sh：./c.sh > tempbatch.sh

8. 给tempbatch.sh加上shell头 #!/bin/bash

执行tempbatch.sh，从而最终提交批处理任务。