Linux下MPICH2集群系统安装手册(采用建立信任ssh）

这是我几天来研究学习的一点成果，发出来与大家共享。其中有什么不足之处请批评指正！

说明：本系统测试环境为Redhat9.0完全安装，并且以获得mpich2-1.0.1.tar.gz软件包。假设你的mpich2-1.0.1.tar.gz软件包已经下载到/root/目录下。以root用户登录。要求会使用vi文本编辑器修改文件。下面以四台pc为例。

准备工作：设置IP，更改主机名为node01,node02,node03,node04.

一、创建SSH信任连接（在root目录下）

1、更改/etc/hosts文件
 #vi /etc/hosts   打开hosts文件，更改如下：

  127.0.0.1 localhost.localdomain localhost
  node01的IP scc-m
  node01的IP node01
  node02的IP node02
  node03的IP node03
  node04的IP node04

2、在node01生成SSH秘钥对.
 #ssh-keygen -t rsa  一路回车即可
 产生.ssh文件,
 #ls -a   查看是否有.ssh文件夹
 
3、进入.ssh目录
 #cd .ssh

4、生成authorized_keys文件
 #cp id_rsa.pub authorized_keys 

5、退出到root目录
 #cd ..

6、建立本身的信任连接
 #ssh node01     按提示输入yes（三个字母要打全）

7、设置node02（node02的root目录下）
 #ssh-keygen -t rsa     生成.ssh文件夹
 #scp node01的IP：/root/.ssh/* /root/.ssh    拷贝node01上的.ssh文件夹覆盖本地的
 #scp node01的IP：/etc/hosts /etc/hosts      拷贝node01上的hosts文件覆盖本地的
 #ssh node01  提示处输入yes回车

 设置node03,node04的方法与node02相同

8、确认四台机器的信任连接已建立
 对每个节点执行：
 #ssh node01
 #ssh node02
 #ssh node03
 #ssh node04
 在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆（"Last login:时间日期"提示信息除外）

二、安装MPICH2(在节点root目录下)

1、解压缩
 #tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz
 或者 #gunzip -c mpich2-1.0.1.tar.gz|tar xf mpich2-1.0.1.tar

2、创建安装目录
 #mkdir /usr/MPICH-instsll

3、进入mpich2解压目录
 #cd mpich2-1.0.1

4、设置安装目录
 #./configure --prefix=/usr/MPICH-install

5、编译
 #make

6、安装
 #make install

7、退出到root目录
 #cd ..

8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量
 #vi .bashrc
 修改后的.bashrc文件如下：

 # .bashrc

 # User specific aliases and functions 
 
 alias rm='rm -i'
 alias cp='cp -i'
 alias mv='mv -i'

 PATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin"   新增加的

 #Source global definitions
 if [ -f /etc/bashrc ]; then
  . /etc/bashrc
 fi

9、测试环境变量设置
 #which mpd
 #which mpicc
 #which mpiexec
 #which mpirun

10、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword
 #vi /etc/mpd.conf

 设置文件读取权限和修改时间
 #touch /etc/mpd.conf
 #chmod 600 /etc/mpd.conf

11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts
 #vi mpd.hosts

 文件内容如下：
 node01
 node02
 node03
 node04

三、测试

1、本地测试
 #mpd &    启动 
 #mpdtrace 观看启动机器
 #mpdallexit 退出

2、通过mpd.hosts运行集群系统
 #mpdboot -n number -f mpd.hosts        number为要起动的机器个数
 #mpdtrace
 #mpdallexit

3、测试运行MPICH的例子程序
 #mpdboot -n 4 -f mpd.hosts   启动4台机器
 #mpiexec -n number /usr/MPICH-install/examples/cpi     number为使用的进程数
 #mpdallexit

4、如果测试不能通过，请进行第四步

四、问题解决

1、通过mpdcheck获得一写帮助信息
 #mpdcheck -pc
 
2、查错
 #mpdcheck -l

3、通过mpd.hosts文件查错
 #mpdcheck -f mpd.hosts  如果无错误
 #mpdcheck -f mpd.hosts  -ssh

4、如果上述无错误，可略过此步
 对任意两台机器进行查错
 m1: #mpdcheck -s  输出主机名host和端口port
 m2: #mpdcheck -c host port

注意：以上四步都是在没有运行mpd的情况下进行的

5、mpd查错
 m1: #mpd -e & 返回使用的端口
 m2: #mpd -h m1 -p echoed_port_m1 &

以上测试通过，集群系统就建成了。

哈工大深圳研究生院智能计算实验室
 贾荣斌
       2005.9.2