安装MPICH和配置SSH

前一段手工配置cluster的mpich和ssh，搞了n多次才算成功，看来手工配置还是比较麻烦的，把我的过程写下来吧，以供大家和我以后的参考。

单个计算节点:4路双核HPDL585（4台，还有点少啊，理想中16台），8GMEM ，enterprise linux ,mpich(不用lvm-mpi)

目前还没有增加管理节点，因为还没找到合适的软件，有个gagnlia，linux cluster mananger下载了还没安装，这两天比较忙，等闲了就装上试试。

一、安装MPICH2

1、解压缩
 #tar -zxvf mpich2-1.0.3.tar.gz

2、创建安装目录
 #mkdir /cluster/server/mpich

3、进入mpich解压目录
 #cd mpich2-1.0.3.tar.gz

4、设置安装目录
 #./configure --prefix=/cluster/server/mpich

5、编译
 #make

6、安装
 #make install

7、退出到softcorr目录
 #cd ..

8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量
 #vi .bashrc
 修改后的.bashrc文件如下：

 # .bashrc

 # User specific aliases and functions

 PATH="$PATH:/cluster/server/mpich/bin"   新增加的

 #Source global definitions
 if [ -f /etc/bashrc ]; then
  . /etc/bashrc
 fi

#source .bashrc 来使更改有效

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二、创建SSH信任连接（在softcorr目录下）

确认server.cluster，node1.cluster两台上的/home

和/home/softcorr 的读写权限都是755.

确认/etc/ssh/sshd_config文件中：
PubkeyAuthentication yes
AuthorizedKeysFile      .ssh/authorized_keys
......
PasswordAuthentication yes

1、更改/etc/hosts文件
 #vi /etc/hosts   打开hosts文件，更改如下：

  127.0.0.1 localhost.localdomain localhost
  192.168.0.62 server.cluster milan1
  192.168.0.2   node1.cluster  milan

2、在node1.cluster生成SSH秘钥对：
 #ssh-keygen -t rsa  一路回车即可
 产生.ssh文件,
 #ls -a   查看是否有.ssh文件夹

3.chmod 755 .ssh

4、进入.ssh目录
 #cd .ssh

5、生成authorized_keys文件
 #cp id_rsa.pub authorized_keys

6、设置node1.cluster（node1.cluster的softcorr目录下）
 #ssh-keygen -t rsa     生成.ssh文件夹

7.chmod 755 .ssh

8.cd .ssh

9. #scp server.cluster:/home/softcorr/.ssh/* .   
拷贝server.cluster上的.ssh文件夹覆盖本地的

10、建立本身的信任连接
 #ssh node1.cluster     按提示输入yes(三个字母要打全）,然后：#ssh server.cluster
此时的两个ssh应该不需要密码了

11、确认两台机器的信任连接已建立
 在server.cluster执行：
 #ssh server.cluster
 #ssh node1.cluster
 也不需要密码了

手工安装ssh必须很小心，否则很容易失败，推荐使用linux cluster manager GUI界面安装，现在我的cluster还是手工配置ssh，比较麻烦，等装了linux cluster manager GUI之后再来写总结。