gnumex - Matlab下调用gcc编译

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软件下载地址: https://sourceforge.net/projects/gnumex

软件安装和使用说明: http://gnumex.sourceforge.net/

软件功能:

在MATLAB上调用MinGW或Cygwin编译C和Fortran的mex代码。

这就意味着，我们可以在MATLAB上编译Linux的C程序代码和调用Linux的库编译出MATLAB能用的Mex程序。What a nice tool!

安装步骤:

1. Sourceforge上下载软件，目前最新版2.01。解压缩到任意一个固定的目录。如C:/MATLAB/gnumex

2. 运行MATLAB, 把上面的目录加入到MATLAB的path中。

3. MATLAB上输入命令gnumex运行安装设置。设置很简单，主要是一下几个方面

- MinGW的root目录 (如果使用的是MinGW的gcc，这里必须设置正确)

- Cygwin的root目录 (同上，使用时设置，否则留空)

- f95 和 gfortran的目录 (有的话就设置，没有的话留空。这个是编译fortran程序选用的编译器)
注意: gfortran是gcc的一个组件，这个一般都有，就在MinGW的root目录/bin下面。最好选上，有备无患。

- linking环境 这里选用mingw或cygwin根据自己的需要设置。注意 -mno-cygwin这一项是指在cygwin中link的时候使用windows的lib. 据说这个Cygwin gcc的option争议很大，功能不健全，在官方的maillist上要求取缔此项功能的言论很多，虽然目前仍然在更新和支持中。所以，建议还是使用MinGW比较好。

- 语言方便，选用自己需要的C/C++或fortran语言。

- Generate 里选择 mex dll. 这个一般是默认的。 当然mex也可以编译成 exe文件。根据需要选择。建议使用mex dll。这个可以再matlab上像一般函数一样直接调用程序，很方便。

关于最后的两个路径，建议默认。最后一个mexopts.bat的路径是MATLAB默认的mex程序设置路径，我们覆盖这个文件将使我们的设置成为mex的默认设置。这样就可以直接调用mex编译，如

mex    你的命令

而不用加参。加参使用的方法如:

mex   -f    你的mex设置文件.bat   你的命令

如果你不想改变默认的mex设置，也可以把这个文件保存在其他方便的位置。需要的时候使用 -f 参数调用。

设置完成后，按make option file确认即可。

提示:

1- 如果想重新设置MATLAB的mex. 可以使用mex -setup 设置。这是matlab的默认命令和gnumex无关。

2- 如果要查看当前mex的设置情况，可以使用mex -v 来查看。

3- 你可以在gnumex的File菜单下，选择save config保存当前的设置界面信息到gnumexcfg.mat中。下次修改的时候可以使用菜单上的Load config调用。

测试运行:

先检查一下mex的设置是否生效

mex -v

我们看到

      MATLAB                 = D:\MATLAB~1 
->    COMPILER               = gcc 
->    Compiler flags: 
         COMPFLAGS           = -c -DMATLAB_MEX_FILE 
         OPTIMFLAGS          = -O3 
         DEBUGFLAGS          = -g

看到上面的gcc了吗，这说明我们的设置已经生效了，现在mex用的是gcc为编译器。

做个c程序的例子

复制MATLAB根目录下 extern\examples\mex\yprime.c 文件到自己的测试目录下。例如gnumex的examples目录下。
输入命令

mex yprime.c

就完成了编译工作，生成 yprime.mexw32 文件。

我们可以在MATLAB上调用这个程序运行看看。

yprime(1,1:4)

ans =

    2.0000    8.9685    4.0000   -1.0947

提醒: MATLAB对命令的优先级是，当前目录下的程序最优先。

使用技巧:

1. 如果你使用的是cygwin, 注意一定要把cygwin里的cygwin1.dll文件(在root的bin里面) 加入到windows的path里（而不是matlab的path里）。因为cygwin的程序需要调用这个动态链接库才能使用。这也是cygwin的不方便之处，而且会影响程序的运行速度。最重要的是，目前该软件对cygwin的版本支持很老(只支持cygwin的gcc 3.2)，现在的4.x都不支持。所以建议使用MinGW吧。那个没版本限制，我已经成功的和最新的gcc4.4.1兼容了。

2. 如果测试程序删不掉，如yprime.mexw32文件无法删除，说明matlab运行了这个程序而没有卸载。我们在MATLAB上输入clear yprime。然后就可以正常删除了。

3. gcc有很多的options，和注意事项。如果大家想更好学习gcc。建议参考官方的文档http://gcc.gnu.org/onlinedocs/，也可以找一份中文的参考文档慢慢研究。

gnumex的gcc使用的默认的options是 -O3 -mcpu=pentium -malign-double -fno-exceptions
需要什么option, 大家可以手动修改mexopts.bat文件。(高级用户使用，不熟悉gcc的人慎用)

4. 调用LAPACK/BLAS的方法。建议直接调用MATLAB里提供的lib静态库。位置在extern/lib/win32/microsoft/   分别是 libmwlapack.lib 和 libmwblas.lib. 使用的时候可以直接输入全地址调用，也可以用 -lmwlapack -lmwblas 作为MATLAB的option使用(放在最后)。 如果想用自己优化过的lapack和blas库，使用的时候可以直接输入全地址。也可以把他们改名，前面加lib，然后 复制到上面提到的位置下，通过-l调用。例如: 你有optlapack.lib文件，改名为liboptlapack.lib 放到extern/lib/win32/microsoft/ 下。然后mex命令中使用的时候加入 -loptlapack 就可以了。

5. 如果你要link一个fortran的obj(o)或lib(a)文件到一个c程序中，那么请注意在编译fortran的时候使用-fno-underscoring。

6. 通过autotool使用makefile调用MATLAB编译mex文件的方法和工具可以参考 http://gnumex.sourceforge.net/autotools/。这是一个非常有用的话题，等于把Windows的MATLAB移植到MinGW下使用。可以通过Makefile大批量编译文件。值得关注和研究。

kaien   26/07/2009

根据大家的回复，由于gnumex的版本到2.01就不更新了，所以不支持MATLAB2008以后的版本，因此我替作者给程序做了修正，算是版本v2.02吧。测试已经兼容了MATLAB2010。

更新文件下载: http://kaienfr.ys168.com/   替换2.01版的同名文件即可使用。

另外，对于matlab2010，使用gnumex编译前，必须用文本编辑器打开matlab目录下的bin/mex.pl文件，把两个$IMPLICIT_LIBS删掉，这样就不会出现gcc: getValidInputLinkLibraries: No such file or directory 的错误了。