Matlab提供了两种方法进行聚类分析
来源:互联网 发布:alpine mysql 编辑:程序博客网 时间:2024/06/07 07:22
一种是利用 clusterdata函数对样本数据进行一次聚类,其缺点为可供用户选择的面较窄,不能更改距离的计算方法;另一种是分步聚类:(1)找到数据集合中变量两两之间的相似性和非相似性,用pdist函数计算变量之间的距离;(2)用 linkage函数定义变量之间的连接;(3)用 cophenetic函数评价聚类信息;(4)用cluster函数创建聚类。
1.Matlab中相关函数介绍
1.1 pdist函数
调用格式:Y=pdist(X,’metric’)
说明:用 ‘metric’指定的方法计算 X 数据矩阵中对象之间的距离。’
X:一个m×n的矩阵,它是由m个对象组成的数据集,每个对象的大小为n。
metric’取值如下:
‘euclidean’:欧氏距离(默认);‘seuclidean’:标准化欧氏距离;
‘mahalanobis’:马氏距离;‘cityblock’:布洛克距离;
‘minkowski’:明可夫斯基距离;‘cosine’:
‘correlation’: ‘hamming’:
‘jaccard’: ‘chebychev’:Chebychev距离。
1.2 squareform函数
调用格式:Z=squareform(Y,..)
说明: 强制将距离矩阵从上三角形式转化为方阵形式,或从方阵形式转化为上三角形式。
1.3 linkage函数
调用格式:Z=linkage(Y,’method’)
说 明:用‘method’参数指定的算法计算系统聚类树。
Y:pdist函数返回的距离向量;
method:可取值如下:
‘single’:最短距离法(默认); ‘complete’:最长距离法;
‘average’:未加权平均距离法; ‘weighted’:加权平均法;
‘centroid’: 质心距离法; ‘median’:加权质心距离法;
‘ward’:内平方距离法(最小方差算法)
返回:Z为一个包含聚类树信息的(m-1)×3的矩阵。
1.4 dendrogram函数
调用格式:[H,T,…]=dendrogram(Z,p,…)
说明:生成只有顶部p个节点的冰柱图(谱系图)。
1.5 cophenet函数
调用格式:c=cophenetic(Z,Y)
说明:利用pdist函数生成的Y和linkage函数生成的Z计算cophenet相关系数。
1.6 cluster函数
调用格式:T=cluster(Z,…)
说明:根据linkage函数的输出Z 创建分类。
1.7 clusterdata函数
调用格式:T=clusterdata(X,…)
说明:根据数据创建分类。
T=clusterdata(X,cutoff)与下面的一组命令等价:
Y=pdist(X,’euclid’);
Z=linkage(Y,’single’);
T=cluster(Z,cutoff);
2. Matlab程序
2.1一次聚类法
X=[11978 12.5 93.5 31908;…;57500 67.6 238.0 15900];
T=clusterdata(X,0.9)
2.2分步聚类
Step1 寻找变量之间的相似性
用pdist函数计算相似矩阵,有多种方法可以计算距离,进行计算之前最好先将数据用zscore函数进行标准化。
X2=zscore(X); %标准化数据
Y2=pdist(X2); %计算距离
Step2 定义变量之间的连接
Z2=linkage(Y2);
Step3 评价聚类信息
C2=cophenet(Z2,Y2); //0.94698
Step4 创建聚类,并作出谱系图
T=cluster(Z2,6);
H=dendrogram(Z2);
分类结果:{加拿大},{中国,美国,澳大利亚},{日本,印尼},{巴西},{前苏联}
剩余的为一类。- Matlab提供了两种方法进行聚类分析
- Matlab提供的两种聚类分析方法
- C#日期相减提供了两种方法。
- 聚类分析matlab
- 聚类分析matlab
- JQuery 提供了两种方式来阻止事件冒泡
- XmlDatasetConvert 该类提供了四种方法:
- 聚类分析方法
- C# 调用 matlab两种方法实现
- 用matlab做聚类分析
- matlab做聚类分析
- 用matlab做聚类分析
- Matlab中的聚类分析
- 用matlab做聚类分析 .
- Matlab聚类分析(Cluster Analyses)
- 【模式识别】聚类分析MATLAB实现
- MATLAB层次聚类分析法
- matlab做聚类分析
- 调整Linux内核解决C500k问题
- java iterator如何倒序输出
- 生成GUID的Java程序
- 会议相关转载笔记
- qt信号槽
- Matlab提供了两种方法进行聚类分析
- zoj1128-Atlantis
- js数组操作大全(转)
- [疯狂Java讲义精粹] 第五章|面向对象(下)
- 2440-中断寄存器详解[转]
- CString 操作指南
- MySQL数据类型char、varchar、text的比较
- 初识win8
- [转载]C++虚函数