MapReduce算法设计--Think in Hadoop

来源:互联网 发布:谷歌关键词优化 编辑:程序博客网 时间:2024/04/30 10:15

本文介绍几种MapReduce算法设计的技巧,全部内容翻译自《Data-Intensive Text Processing with MapReduce》。

Local Aggregation

说到Local Aggregation,你可能会想不就是Combiner吗。实际上在mapper中进行combining比使用真正的combiner高效得多。首先combiner只是作为MapReduce的可选优化方案(就像inline对于C++编译器是一种可选优化方案一样),不一定会被执行。其次在mapper中进行combining可以减少很多的I/O操作,提高效率,毕竟mapper的每个结果都个结果都要被写入磁盘,我们当然希望写入磁盘的数据越少越好。

回想一下WordCount的例子,在mapper中Emit(word,1),在reducer中对相同的键值Emit(word,sum),而combiner采用和reducer一样的例程。

现在我们要在mapper中就把combiner的事情给做了。

?
class Mapper
    method setup
        H := new AssociativeArray
    method map(docid a,doc d)
        foreach term in doc
            H{term} := H{term}+1
    method cleanup
        foreach term in H
            Emit(term,value of H{term})

但是上述方法在可扩展性上会遇到瓶颈:我们必须在内存中维持一个关联数组H,当mapper接收到的数据分片很大,里面有很多word时,H就会很大,甚至超出内存。解决办法有两种:

  1. 设定一个值K,mapper每读入K条键值对,就把H中的内容全部Emit,然后把H清空接着读入键值对。类似于先读满一个buffer,再把它flush掉,然后buffer重复利用。
  2. 在mapper中监控内存的使用率,当达到一定阈值时,就把H的内容flush。

使用Local Aggregation设计算法的正确性

有一个计算平均值的例子。输入文件中的每一行记录着(string,count)表示一个单词出现的次数,在所有的记录中相同的string会出现多次,现在我们要计算每一个string的平均count。

求和是一种“分配型”的聚合,即

但求平均不是分配型的,即

一种直接的想法是:

?
class Mapper
    method map(string word,integer count)
        Emit(word,count)
 
class Reducer
    method reduce(string word,integer-list [c1,c2,...])
        sum := 0
        cnt := 0
        foreach integer c in [c1,c2,...]
            sum := sum+c
            cnt := cnt+1
        avg := sum/cnt
        Emit(word,avg)

现在我们想使用combiner进行local aggregation。在上面的代码中,很容易地可以将reducer的部分工作放到combiner中来完成。

?
class Mapper
    method map(string word,integer count)
        Emit(word,count)
         
class Combiner
    method reduce(string word,integer-list [c1,c2,...])
        sum := 0
        cnt := 0
        foreach integer c in [c1,c2,...]
            sum := sum+c
            cnt := cnt+1
        Emit(word,pair(sum,cnt))
 
class Reducer
    method reduce(string word,pairs[(s1,c1),(s2,c2),...])
        sum := 0
        cnt := 0
        foreach pair(s,c) in pairs[(s1,c1),(s2,c2),...]
            sum := sum+s
            cnt := cnt+c
        avg := sum/cnt
        Emit(word,avg)

很遗憾上面的代码是错误的,不符合MapReduce的规范,由于Combiner只是可选的优化方案,所以MapReduce要求在没有Combiner的情况下程序仍能正确的运行。上述代码mapper的输出键值对和reducer的输入键值对类型不匹配,导致程序无法运行。还好,我们只需要把mapper稍作修改就可以了。

?
class Mapper
    method map(string word,integer count)
        Emit(word,pair(count,1))

进一步,现在我们想把local aggregation从combiner中转移到mapper中,与wordcount例子中使用的技巧一样,使用关联数组!

?
class Mapper
    method setup
        S := new AssociativeArray
        C := new AssociativeArray
    method map(string word,integer count)
        S{word} := S{word}+count
        C{word} := C{word}+1
    method cleanup
        foreach word in S
            Emit(word,pair(S{word},C{word}))

Pairs and Stripes

mapper和reducer之间能够交换的数据仅仅是一个键值对,很多时候我们为了使这一个键值对中包含更多的信息,就把键或值设计得足够复杂,比如让它是一个pair或AssociativeArray。在上文中我们已经看到这种应用实例了。

在N-Gram模型中,我们要计算一个方阵A,其规模是N×N,N是语料库中单词的个数。A[i][j]表示单词j在单词i的领域中出现的次数。

Pairs方式:

?
class Mapper
    method map(docid a,doc d)
        foreach term w in doc
            foreach term u in Neighbour(w)
                Emit(pair(w,u),1)
                 
class Reducer
    method reduce(pair p,counts [c1,c2,...])
        s := 0
        foreach count c in [c1,c2,...]
            s := s+c
        Emit(p,s)

Stripes方式:

?
class Mapper
    method map(docid a,doc d)
        foreach term w in doc
            H := new AssociativeArray
            foreach term u in Neighbour(w)
                H{u} := H{u}+1
            Emit(w,H)
                 
class Reducer
    method reduce(term w,stripes [H1,H2,...])
        F := new AssociativeArray
        foreach stripe H in [H1,H2,...]
            sum(F,H)
        Emit(w,F)

上述pairs和stripe方式都可以很轻松的写一个combiner来提高效率,并且在stripes方式中combiner发挥的作用会相对大一些。

注意在Stripes方式中,由于要为doc中的每一个term建立一个AssociativeArray,维持这么多的关联数组可能会导致内存溢出。解决方案在本文的第一小节已经提到了。

stripe方式要比pairs方式快得多,因为pairs方式Emit操作(即写磁盘操作)太频繁了。

Computing Relative Frequencies

还说N-Gram这个问题,刚才我们只是计算了单词u在单词w的领域内出现的次数,但是个次数多并不能说明u和w的关系就强烈,因为可能是w太平凡了,导致w出现的次数很多,进而导致w和u相伴出现的次数也很多。另外有一对单词p和q,它们相伴出现的次数比较少并不能说明它们的关系不强烈,可能是因为在语料库p总共出现的次数也不多。所以我们应该计算“相对频率”才是合理的:

实际上就是对已有矩阵的每一行求和,再让该行的每个元素除以这个和。

使用上面的Stripes方式代码可以很容易地扩展为计算相对频率的代码,因为在redcuer中Emit的每一个键值对刚好对应矩阵的一行数据,计算矩阵的行和非常方便。

现在我们要在pairs方式中计算相对频率该怎么做呢?因为mapper输入的键值对是(pair(w,u),1),要计算行和就必须使所相同的w都到一个reducer中,但默认情况下Hadoop只能保证相同的pair(w,u)映射到同一个reducer当中--对于复杂的键类型,MapReduce中要把它转换成bytes再进行Hash。因此我们需要重写Partitioner,仅对pair的左值(即w)进行散列,这就可以保证相同的w都映射到了同一个reducer。但是注意,映射到同一个reducer的pair的左值可能不只一种。MapReduce保证映射到同一个reducer的键值对都是按键排序好的,为了使在同一个reducer中,相同的左值是连续在一起的,我们还需要自定义的pair的比较方式:对pair进行比较时,只比较左值。

?
class Pair
    method compareTo(Pair obj)
        rect := this.left.compareTo(obj.left)
        if(rect == 0)
            if(this.right == "*")
                return -1
            else if(obj.right == "*")
                return 1
        return rect
 
class Mapper
    method map(docid a,doc d)
        foreach term w in doc
            foreach term u in Neighbour(w)
                Emit(Pair(w,u),1)
                Emit(Pair(w,*),1)
                 
class Partitioner
    method getPartition(Pair key)
        return key.getLeft().hashCode()
                 
class Reducer
    method setup
        prev := NULL
        rowsum := 0
    method reduce(pair p,counts [c1,c2,...])
        foreach count c in [c1,c2,...]
            s := s+c
        if(p.left != prev)
            assert(p.right == "*")
            prev := p.left
            rowsum := s
        else
            Emit(p,s/rowsum)

上面的代码中,我们使mapper多输出了一项Emit(Pair(w,*),1),它的作用是使在reducer中不需要遍历所有具有相同左值的pair(w,u)就能提前计算出行和--仅依靠pair(w,*)就可计算出行和,这样在第一次遇到pair(w,u)时就可以计算出它的相对频率。为了使reducer最先遇到pair(w,*),我们定义在对pair排序时,在左值相同的情况下,右值为“*"者较小。

在一个reducer中出现的键值对的顺序是这样子的:

同样,仍然可以使用combiner进行优化,把local aggregate放在mapper中更好。

说到这里顺便扯一句,一般程序员在计算样本方差时会采用这个公式:

这个公式要求2趟扫描样本,第1趟扫描是为了计算出X的平均值,第2趟扫描是按照公式来计算。而统计学专业的学生知道计算方差还有另外一个公式:

只需要1趟扫描就可以把ΣXi2和ΣXi都算出来,直接代入公式就可算出方差。

Secondary Sorting

Hadoop只能保证同一个reducer中的健值对是按键排好序的,在Goole在MapReduce中提供一个可选的函数--在按键排序之后按value排序。考虑这么一种情形:mapper输出的键值对形如

key   value

t1    (m1,r1988)

t1    (m2,r1987)

t2    (m1,r1990)

key已经排好序了,t1<t2。我们希望key相同的时候按value中的第2列排序,即希望的结果为

key   value

t1    (m2,r1987)

t1    (m1,r1988)

t2    (m1,r1990)

Hadoop是不对value进行排序的,所以我们的解决方法是:把需要排序的valueu部分放到key里面去,即

key      value

(t1,r1987)   m2

(t1,r1988)   m1

(t2,r1990)   m1

当然这个时候需要自定义partitioner仅对pair的左值进行散列,且pair的比较规则是先比较左值,左值相等时再比较右值。

原文来自:博客园(华夏35度)http://www.cnblogs.com/zhangchaoyang 作者:Orisun
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