R脚本并行运行

执行mpirun时，指定hosts可以用选项-H或-host（逗号分割的hosts列表），或者用选项-hostfile指定一个host file。可以使用-n或-np选项指定在这些节点（即hosts）上运行的脚本的副本数量。

若-n或-np为1，指定只运行脚本的一个副本，在运行startMPIcluster时，doMPI会使用Rmpi的mpi.comm.spawn函数为你启动多个workers。

若-n或-np大于1，则doMPI不会spawn workers，而是假定你已使用mpirun启动了所需要的全部workers。这意味着，你的脚本将有多个实例开始运行。或者说，workers将要执行你的脚本。在这种情况下，你的脚本应该在开始时就调用startMPIcluster函数。当一个worker调用startMPIcluster时，该函数会发出通知，并执行workerLoop函数，以便执行由Master（即"rank0"过程，如上例中的localhost本机）提交的任务。

mpirun -H localhost,n2,n3 R --slave -f myscript.R

这一mpirun指令将在localhost, n2和n3上运行R解释器，R将在当前目录下运行名为myscript.R的脚本。myscript.R的副本（copy)在master（"rank 0"过程，即localhost）上运行，并从startMPIcluster中返回。而另外2个workers（即主机n2和n3）因为运行workLoop函数而不返回。因此，应在脚本的开始就执行starMPIcluster，否则，workers将会执行本应由master执行的代码，从而导致问题。

mpirun -H n1,n2,n3 -n 1 R --slave -f myscript.R

在节点n1上启动master，将n2和n3也列入hosts，则MPI "universe"中将包含3个节点。因为指定了-n为1，mpirun指令只启动一个R解释器运行。startMPIcluster检测到mpi.universe.size()为3，因此它将spawn两个workers，他们分别在节点n2和n3上运行。

Open MPI建议使用non-spawn模式，因为其性能更好。在运行一个batch queueing系统（如slurm时），很可能也需要使用non-spawn模式。但是，如果脚本需要在startMPIcluster之前进行其他操作（可能会在worker processes上fail），或者需要创建多个cluster时，只能通过指定-n为1使用spawn（dynamic）模式。

mpirun -H localhost,n2,n3 -n 6 R --slave -f myscript.R

使用non-spawn（static）模式在hosts上启动多处理器。在每个host上启动2个处理器（共6个处理器）。master和一个worker在localhost上运行，而n2和n3上分别运行2个workers。你可以设置-n为1，在脚本中使用startMPIcluster时设置count参数为5，指定spawn五个workers。

通常不提倡使用starMPIcluster函数的count参数，除非要做些特别的事，如创建多个clusters。若要在non-spawn模式下指定count参数的值，应当设为mpi.comm.size()-1，否则startMPIcluster将产生错误。