qsub提交到PBS的脚本中不能使用 &（后台运行命令）？！

来源：互联网发布：java笔试题及答案2017 编辑：程序博客网时间：2024/06/02 07:31

如 pbs_script.sh：

#!/bin/bash -myprog arg1 arg2 &

直接前台交互运行上面的脚本（即：./pbs_script.sh）时，myprog能正常运行并输出相应结果。但是，如果用qsub提交上面的脚本到PBS作业系统时，myprog却不会被运行。

若去掉后台运行命令&，则提交PBS时myprog也能正常运行。即：

myprog arg1 arg2

其原因在于：

原来的代码，PBS作业系统读取脚本到第二行&处时，将 myprog 交给后台，然后立即退出了该脚本。但是此时扔到后台的myprog还没来得及返回运行结果给PBS。所以造成PBS没有返回myrpog的结果给用户。

据此，任何PBS脚本（即用qsub命令提交给PBS作业系统的shell脚本）中，一旦使用了后台运行命令&，其后一定要加上wait命令。即：

#!/bin/bash -myprog arg1 arg2 &wait

这样，PBS读取完第二句后会先等待后台返回myprog的运行结果，然后才退出该脚本。

Thanks for suggests from: http://biowulf.nih.gov/user_guide.html

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