POJ 3080 Blue Jeans (后缀数组)

来源:互联网 发布:金蝶实体数据库丢失 编辑:程序博客网 时间:2024/06/05 03:40

题目大意:

求出这些DNA序列中的最长且字典序最小的公共子串。


思路分析:

二分长度的答案,去height中扫描这个长度是否满足,一旦满足就马上输出,这样就可以保证字典序最小了。


#include <cstdio>#include <iostream>#include <cstring>#include <algorithm>#define maxn 1005using namespace std;char str[maxn];int sa[maxn],t1[maxn],t2[maxn],c[maxn],n;void suffix(int m){    int *x=t1,*y=t2;    for(int i=0;i<m;i++)c[i]=0;    for(int i=0;i<n;i++)c[x[i]=str[i]]++;    for(int i=1;i<m;i++)c[i]+=c[i-1];    for(int i=n-1;i>=0;i--)sa[--c[x[i]]]=i;    for(int k=1;k<=n;k<<=1)    {        int p=0;        for(int i=n-k;i<n;i++)y[p++]=i;        for(int i=0;i<n;i++)if(sa[i]>=k)y[p++]=sa[i]-k;        for(int i=0;i<m;i++)c[i]=0;        for(int i=0;i<n;i++)c[x[y[i]]]++;        for(int i=0;i<m;i++)c[i]+=c[i-1];        for(int i=n-1;i>=0;i--)sa[--c[x[y[i]]]]=y[i];        swap(x,y);        p=1;x[sa[0]]=0;        for(int i=1;i<n;i++)        x[sa[i]]=y[sa[i-1]]==y[sa[i]]&&y[sa[i-1]+k]==y[sa[i]+k]?p-1:p++;        if(p>=n)break;        m=p;    }}int rank[maxn],height[maxn];void getheight(){    int k=0;    for(int i=0;i<n;i++)rank[sa[i]]=i;    for(int i=0;i<n;i++)    {        if(k)k--;        if(!rank[i])continue;        int j=sa[rank[i]-1];        while(str[i+k]==str[j+k])k++;        height[rank[i]]=k;    }}int pos,N,fans;bool vis[20];int bel[maxn];bool ok(){    for(int i=1;i<=N;i++)        if(!vis[i])return false;    return true;}bool check(int len){    pos=-1;    memset(vis,false,sizeof vis);    int i;    for(i=1;i<n;i++)    {        if( height[i]<len )        {            if(ok())            {                pos=sa[i-1];                return true;            }            memset(vis,false,sizeof vis);        }        else        {            if(!vis[bel[sa[i-1]]])vis[bel[sa[i-1]]]=true;            if(!vis[bel[sa[i]]])vis[bel[sa[i]]]=true;            if(ok())            {                pos=sa[i];                return true;            }        }    }    if(ok())pos=sa[i-1];    return pos!=-1;}char tmp[100];int main(){    int T;    scanf("%d",&T);    while(T--)    {        scanf("%d",&N);        int top=0;        for(int i=1;i<=N;i++)        {            scanf("%s",tmp);            for(int j=0;j<60;j++)            {                bel[top]=i;                str[top++]=tmp[j];            }            bel[top]=i;            str[top++]=127-i;        }        str[top-1]=0;        n=top;        suffix(128);        getheight();        int l=3,r=60,mid,ans=0;        while(l<=r)        {            mid=(l+r)>>1;            if(check(mid))ans=mid,fans=pos,l=mid+1;            else r=mid-1;        }        if(ans<3)printf("no significant commonalities");        else        {            for(int i=fans;i<fans+ans;i++)printf("%c",str[i]);        }        puts("");    }    return 0;}


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