Kmean算法

来源:互联网 发布:用plsql导入excel数据 编辑:程序博客网 时间:2024/05/24 05:07
Kmeans算法是最为经典的基于划分的聚类方法,是十大经典数据挖掘算法之一。Kmeans算法的基本思想是:以空间中k个点为中心进行聚类,对最靠近他们的对象归类。通过迭代的方法,逐次更新各聚类中心的值,直至得到最好的聚类结果。
假设要把样本集分为K个类别,算法描述如下:
(1)适当选择K个聚类的初始中心;
(2)在第K次迭代中,对任意一个样本,求其到K个中心的距离,将该样本归到距离最短的中心所在的簇;
(3)重新计算各个簇(聚类)的中心;
(4)对于所有的K个聚类中心,如果利用(2)(3)反复迭代,重新计算新旧中心的距离,若距离不变或小于某个阀值,则迭代结束。
该算法的最大优势在于简洁和快速。算法的关键在于初始中心的选择和距离公式。
这里最关键的地方就是初始中心K的选择,这里的选择好坏会很大程度上影响最终聚类的结果。
算法实现:下面简单利用距离计算方式演示聚类效果:
package com.wxshi.kmean;import java.io.BufferedReader;import java.io.FileInputStream;import java.io.IOException;import java.io.InputStreamReader;import java.util.ArrayList;import java.util.List;/** * Kmeans算法演示 * @author wxshi * */public class Kmeans {private List<ArrayList<Double>> centers;private List<ArrayList<Double>> newCenters;private List<ArrayList<ArrayList<Double>>> clusterList;private int clusterNum = 5; //默认聚类的个数/** * 默认构造不对外抛 */private Kmeans(){}public Kmeans(int clusterNum){if(clusterNum<=0){clusterNum = 5;}this.clusterNum = clusterNum;centers = new ArrayList<ArrayList<Double>>();newCenters = new ArrayList<ArrayList<Double>>();clusterList = new ArrayList<ArrayList<ArrayList<Double>>>();}/** * 初始化簇,开始为空 * @param args * @throws IOException */public List<ArrayList<ArrayList<Double>>> initclusterList() {clusterList = new ArrayList<ArrayList<ArrayList<Double>>>();for (int i = 0; i < clusterNum; i++) {clusterList.add(new ArrayList<ArrayList<Double>>());}return clusterList;}/** * 初始化聚类中心节点,随机选择 * 这里随便选择几个 * @param dataList */private void initCenters(List<ArrayList<Double>> dataList){for (int i = 0; i < clusterNum; i++) {centers.add(dataList.get(i + 2));clusterList.add(new ArrayList<ArrayList<Double>>());}}/** * 新旧中心切换 * 清空原来的簇中数据,重新放置数据 */private void replaceCenters() {centers = new ArrayList<ArrayList<Double>>(newCenters);newCenters = new ArrayList<ArrayList<Double>>();initclusterList();}/** * 欧式距离计算 * @param element1 * @param element2 * @return */private double distance(double element1,double element2){double distance = 0;distance = ((element1 - element2) / (element1 + element2)) * ((element1 - element2) / (element1 + element2));return distance;}/** * 新旧聚类中心距离计算 * @return */private double distanceOfCenters() {// 计算新旧中心之间的距离,当距离小于阈值时,聚类算法结束double distance = 0;for (int i = 0; i < clusterNum; i++) {for (int j = 0; j < centers.get(i).size(); j++) {// 计算两点之间的距离distance += distance(centers.get(i).get(j) , newCenters.get(i).get(j));}}return distance;}/** * 重新计算聚类中心 */private void newCenters() {for (int i = 0; i < clusterNum; i++) {int len = clusterList.get(i).size();ArrayList<Double> tmpList = new ArrayList<Double>();for (int j = 0; j < centers.get(0).size(); j++) {double sum = 0;for (int t = 0; t < len; t++) {sum += clusterList.get(i).get(t).get(j);}tmpList.add(sum / len);}newCenters.add(tmpList);}}/** * 核心方法 * 迭代簇,将距离最近的节点加入簇 * @param dataList */private void intoCuster(List<ArrayList<Double>> dataList){for (int i = 0; i < dataList.size(); i++) {double minDistance = 99999999;int centerIndex = -1;for (int j = 0; j < clusterNum; j++) {// 计算最近距离double currentDistance = 0;for (int t = 0; t < centers.get(j).size(); t++) {// 计算两点之间的距离currentDistance += distance(centers.get(j).get(t) , dataList.get(i).get(t)) ;}if (minDistance > currentDistance) {minDistance = currentDistance;centerIndex = j;}}clusterList.get(centerIndex).add(dataList.get(i));}}/** * 读取文件,获取数据 * @param dir * @return */public List<ArrayList<Double>> readFile(String dir) {List<ArrayList<Double>> dataList = new ArrayList<ArrayList<Double>>();try {BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(new FileInputStream("wine.txt")));String data = null;while ((data = br.readLine()) != null) {String[] fields = data.split(",");List<Double> tmpList = new ArrayList<Double>();for (int i = 0; i < fields.length; i++) {tmpList.add(Double.parseDouble(fields[i]));}dataList.add((ArrayList<Double>) tmpList);}br.close();} catch (IOException e) {e.printStackTrace();}return dataList;}/** * 打印结果 */private void print() {for (int i = 0; i < clusterNum; i++) {System.out.println("\nCluster: " + (i + 1) + "   size: " + clusterList.get(i).size() + " :\n");for (int j = 0; j < clusterList.get(i).size(); j++) {System.out.println(clusterList.get(i).get(j));}}}/** * @param args * @throws IOException */public static void main(String[] args) throws IOException {Kmeans kmeans = new Kmeans(5);// 读入原始数据List<ArrayList<Double>> dataList = kmeans.readFile("wine.txt");// 随机确定K个初始聚类中心kmeans.initCenters(dataList);// 进行若干次迭代,直到聚类中心稳定while (true) {kmeans.intoCuster(dataList);kmeans.newCenters();double distance = kmeans.distanceOfCenters();// 小于阈值时,结束循环if (distance == 0) {break;}// 否则,新的中心来代替旧的中心,进行下一轮迭代else {kmeans.replaceCenters();}}kmeans.print();}}
下面代码摘自网页中,这里做个比较:
import java.util.ArrayList;import java.util.Random;/** * K均值聚类算法 */public class Kmeans2 {    private int k;// 分成多少簇    private int m;// 迭代次数    private int dataSetLength;// 数据集元素个数,即数据集的长度    private ArrayList<float[]> dataSet;// 数据集链表    private ArrayList<float[]> center;// 中心链表    private ArrayList<ArrayList<float[]>> cluster; // 簇    private ArrayList<Float> jc;// 误差平方和,k越接近dataSetLength,误差越小    private Random random;    /**     * 设置需分组的原始数据集     * @param dataSet     */    public void setDataSet(ArrayList<float[]> dataSet) {        this.dataSet = dataSet;    }    /**     * 获取结果分组     * @return 结果集     */    public ArrayList<ArrayList<float[]>> getCluster() {        return cluster;    }    /**     * 构造函数,传入需要分成的簇数量     * @param k     *            簇数量,若k<=0时,设置为1,若k大于数据源的长度时,置为数据源的长度     */    public Kmeans2(int k) {        if (k <= 0) {            k = 1;        }        this.k = k;    }    /**     * 初始化     */    private void init() {        m = 0;        random = new Random();        if (dataSet == null || dataSet.size() == 0) {            initDataSet();        }        dataSetLength = dataSet.size();        if (k > dataSetLength) {            k = dataSetLength;        }        center = initCenters();        cluster = initCluster();        jc = new ArrayList<Float>();    }    /**     * 如果调用者未初始化数据集,则采用内部测试数据集     */    private void initDataSet() {        dataSet = new ArrayList<float[]>();        // 其中{6,3}是一样的,所以长度为15的数据集分成14簇和15簇的误差都为0        float[][] dataSetArray = new float[][] { { 8, 2 }, { 3, 4 }, { 2, 5 },                { 4, 2 }, { 7, 3 }, { 6, 2 }, { 4, 7 }, { 6, 3 }, { 5, 3 },                { 6, 3 }, { 6, 9 }, { 1, 6 }, { 3, 9 }, { 4, 1 }, { 8, 6 } };        for (int i = 0; i < dataSetArray.length; i++) {            dataSet.add(dataSetArray[i]);        }    }    /**     * 初始化中心数据链表,分成多少簇就有多少个中心点     *     * @return 中心点集     */    private ArrayList<float[]> initCenters() {        ArrayList<float[]> center = new ArrayList<float[]>();        int[] randoms = new int[k];        boolean flag;        int temp = random.nextInt(dataSetLength);        randoms[0] = temp;        for (int i = 1; i < k; i++) {            flag = true;            while (flag) {                temp = random.nextInt(dataSetLength);                int j = 0;                while (j < i) {                    if (temp == randoms[j]) {                        break;                    }                    j++;                }                if (j == i) {                    flag = false;                }            }            randoms[i] = temp;        }        for (int i = 0; i < k; i++) {            center.add(dataSet.get(randoms[i]));// 生成初始化中心链表        }        return center;    }    /**     * 初始化簇集合     *     * @return 一个分为k簇的空数据的簇集合     */    private ArrayList<ArrayList<float[]>> initCluster() {        ArrayList<ArrayList<float[]>> cluster = new ArrayList<ArrayList<float[]>>();        for (int i = 0; i < k; i++) {            cluster.add(new ArrayList<float[]>());        }        return cluster;    }    /**     * 计算两个点之间的距离     *     * @param element     *            点1     * @param center     *            点2     * @return 距离     */    private float distance(float[] element, float[] center) {        float distance = 0.0f;        float x = element[0] - center[0];        float y = element[1] - center[1];        float z = x * x + y * y;        distance = (float) Math.sqrt(z);        return distance;    }    /**     * 获取距离集合中最小距离的位置     *     * @param distance     *            距离数组     * @return 最小距离在距离数组中的位置     */    private int minDistance(float[] distance) {        float minDistance = distance[0];        int minLocation = 0;        for (int i = 1; i < distance.length; i++) {            if (distance[i] < minDistance) {                minDistance = distance[i];                minLocation = i;            } else if (distance[i] == minDistance) // 如果相等,随机返回一个位置            {                if (random.nextInt(10) < 5) {                    minLocation = i;                }            }        }        return minLocation;    }    /**     * 核心,将当前元素放到最小距离中心相关的簇中     */    private void clusterSet() {        float[] distance = new float[k];        for (int i = 0; i < dataSetLength; i++) {            for (int j = 0; j < k; j++) {                distance[j] = distance(dataSet.get(i), center.get(j));            }            int minLocation = minDistance(distance);            cluster.get(minLocation).add(dataSet.get(i));// 核心,将当前元素放到最小距离中心相关的簇中        }    }    /**     * 求两点误差平方的方法     *     * @param element     *            点1     * @param center     *            点2     * @return 误差平方     */    private float errorSquare(float[] element, float[] center) {        float x = element[0] - center[0];        float y = element[1] - center[1];        float errSquare = x * x + y * y;        return errSquare;    }    /**     * 计算误差平方和准则函数方法     */    private void countRule() {        float jcF = 0;        for (int i = 0; i < cluster.size(); i++) {            for (int j = 0; j < cluster.get(i).size(); j++) {                jcF += errorSquare(cluster.get(i).get(j), center.get(i));            }        }        jc.add(jcF);    }    /**     * 设置新的簇中心方法     */    private void setNewCenter() {        for (int i = 0; i < k; i++) {            int n = cluster.get(i).size();            if (n != 0) {                float[] newCenter = { 0, 0 };                for (int j = 0; j < n; j++) {                    newCenter[0] += cluster.get(i).get(j)[0];                    newCenter[1] += cluster.get(i).get(j)[1];                }                // 设置一个平均值                newCenter[0] = newCenter[0] / n;                newCenter[1] = newCenter[1] / n;                center.set(i, newCenter);            }        }    }    /**     * 打印数据,测试用     * @param dataArray     *            数据集     * @param dataArrayName     *            数据集名称     */    public void printDataArray(ArrayList<float[]> dataArray, String dataArrayName) {        for (int i = 0; i < dataArray.size(); i++) {            System.out.println("print:" + dataArrayName + "[" + i + "]={" + dataArray.get(i)[0] + "," + dataArray.get(i)[1] + "}");        }        System.out.println("===================================");    }    /**     * Kmeans算法核心过程方法     */    private void kmeans() {        init();        // 循环分组,直到误差不变为止        while (true) {            clusterSet();            countRule();            // 误差不变了,分组完成            if (m != 0) {                if (jc.get(m) - jc.get(m - 1) == 0) {                    break;                }            }            setNewCenter();            m++;            cluster.clear();            cluster = initCluster();        }    }    /**     * 执行算法     */    public void execute() {        long startTime = System.currentTimeMillis();        System.out.println("kmeans begins");        kmeans();        long endTime = System.currentTimeMillis();        System.out.println("kmeans running time=" + (endTime - startTime) + "ms");        System.out.println("kmeans ends");        System.out.println();    }    public  static void main(String[] args){        //初始化一个Kmean对象,将k置为10        Kmeans2 k=new Kmeans2(4);        ArrayList<float[]> dataSet=new ArrayList<float[]>();        dataSet.add(new float[]{1,22});        dataSet.add(new float[]{3,333});        dataSet.add(new float[]{3,4});        dataSet.add(new float[]{5,6});        dataSet.add(new float[]{8,9999});        dataSet.add(new float[]{4,5});        dataSet.add(new float[]{6,4});        dataSet.add(new float[]{3,95});        dataSet.add(new float[]{5,9});        dataSet.add(new float[]{4,7777});        dataSet.add(new float[]{1,9});        dataSet.add(new float[]{7,844});        //设置原始数据集        k.setDataSet(dataSet);        //执行算法        k.execute();        //得到聚类结果        ArrayList<ArrayList<float[]>> cluster=k.getCluster();        //查看结果        for(int i=0;i<cluster.size();i++){            k.printDataArray(cluster.get(i), "cluster["+i+"]");        }    }}

大致思想不变:就是不断选择聚类中心,根据距离选择加入簇的节点,不断迭代,直到距离小于某个阀值或不变则聚类结束。
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