Error: Could not find Bowtie 2 index files 可能是这里错了

来源:互联网 发布:北杉切削液淘宝有卖吗 编辑:程序博客网 时间:2024/06/07 22:26

导致上面这个错误的原因是,tophat无法找到你的索引文件,有可能是你路径写错了。

记住,这个索引路径是要把基因组的名字也写上的。比如你的基因组是rabbit.fasta,

而你的.bt2文件是存放在/home/下面,那么完整的路径应该是:/home/rabbit     (请注意别加上后缀fasta).

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