安装get_homologues

官方网址

https://omictools.com/get-homologues-tool

帮助文档

https://github.com/eead-csic-compbio/get_homologues/blob/master/manual_get_homologues.pdf

软件安装步骤

1 软件获取

wget https://github-cloud.s3.amazonaws.com/releases/46931871/af7a24f0-240a-11e6-8c41-e87b0ee2ed8d.tgz?X-Amz-Algorithm=AWS4-HMAC-SHA256&X-Amz-Credential=AKIAISTNZFOVBIJMK3TQ%2F20160622%2Fus-east-1%2Fs3%2Faws4_request&X-Amz-Date=20160622T142013Z&X-Amz-Expires=300&X-Amz-Signature=672fd831dd3147c8bbb843b5d1dbd2de9b7144cd5756069f48342bf69a4d5170&X-Amz-SignedHeaders=host&actor_id=0&response-content-disposition=attachment%3B%20filename%3Dget_homologues-x86_64-20160527.tgz&response-content-type=application%2Foctet-stream

2 解压

tar zxvf get_homologues-2.0.16.tar.gz

3 阅读README文件

注意：所有依赖软件均需安装至’get_homologues-2.0.16/bin’目录下。

依赖软件

1 COGtriangles（COGsoft）
2 hmmer（hmmer-3.1b2）
3 MCL（mcl-14-137）
4 BLAST（ncbi-blast-2.2.27+）

4 修改依赖软件文件夹名称

mv COGsoft.04.19.2012/ COGsoftmv hmmer-3.1b2-linux-intel-x86_64/ hmmer-3.1b2mv mcl-14-137* mcl-14-137mv ncbi-blast-2.2.27+*/ ncbi-blast-2.2.27+

5 安装get_homologues

cd get_homologues-2.0.16perl install.pl

安装截图：

安装过程中会提示下载两个依赖软件（Pfam-A，SWISSPROT），选择‘y’即可。