spark on yarn作业运行的jar包缓存优化

来源:互联网 发布:破解手机收费软件 编辑:程序博客网 时间:2024/05/29 17:37
这几天一直在追查spark on yarn的作业运行中的jar包分发,以及执行后的jar包删除的问题。从一开始的毫无头绪,到后来逐渐清晰,到后来通过hadoop的两个很简单的参数配置解决了问题。不得不说,虽然问题不大,对某些大牛们来说也真是小case,但是追查问题,定位问题到最终解决问题的过程,对我来说真是很不错的体验和学习过程。下面详细描述一下遇到的问题,以及解决的过程,给后面的同学一点参考。

BTW,很多时候定位问题,查清楚问题的原因,比解决这个”问题“要更重要。


问题描述

Spark版本是1.0.2,运行在cdh5.1.0-hadoop2.3.0版本的yarn上面。在每次提交作业执行之后,在我的HDFS的${yarn.app.mapreduce.am.staging-dir}/${username}/.sparkStaging下面,就会产生两个jar包,一个是spark-assembly-*.jar,另一个是提交执行的jar包。同时,在这个作业对应的executor的节点上,${yarn.nodemanager.local-dirs}目录下,也会有这两个jar包。而且不会被删除。

光spark-assembly*.jar就有一百多M,每次执行完都会留下这么多jar包,虽然不大,但可想而知,日积月累,可是个很麻烦的事情。所以,要搞清楚为啥会出现这个情况。


这个问题可以拆分成两个sub-task,一个是HDFS上的jar包为啥不会自动删除,一个是nodemanager节点上的jar包的自动删除。下面分别排查和解决:

HDFS上的jar包缓存

网上貌似很少有相关资料,就是找到了一个介绍如何配置spark.yarn.jar的文章,说是可以解决HDFS上的jar包缓存的问题。照着配置了一下,不起作用,又看作者说,要spark1.1.0以上的版本,所以重新编译了spark1.1.0,把集群的spark1.0.2升级到1.1.0。重新配置spark.yarn.jar,发现问题解决了。HDFS上仍然在每次提交作业时都会被上传两个jar包,但是用完后会自动删除。

配置方法

(1) 首先需要确保spark在1.1.0以上的版本。

(2) 在HDFS上建立一个公共lib库,比如/system/spark-lib/,设置权限为755。把spark-assembly-*.jar上传到公共lib库中。

(3) 在spark-env.sh中配置:

[html] view plain copy
  1. spark.yarn.jar                          hdfs://yarncluster/system/spark_lib/spark-assembly-1.1.0-hadoop2.3.0-cdh5.1.0.jar  
  2. spark.yarn.preserve.staging.files       false

**spark.yarn.jar配置成HDFS上的公共lib库中的jar包。这个配置项会使提交job时,不是从本地上传spark-assembly*.jar包,而是从HDFS的一个目录复制到另一个目录(不确定HDFS上的复制是怎么操作的),总的来说节省了一点时间。(网上有的文章里说,这里的配置,会节省掉上传jar包的步骤,其实是不对的,只是把从本地上传的步骤改成了在HDFS上的复制操作。)

**spark.yarn.preserve.staging.files: 这个配置项配置成false,表示在执行结束后,不保留staging files,也就是两个jar包。然后HDFS上的.sparkStaging下的两个jar包在作业执行完成后就会被删除。如果配置成true,执行完后HDFS上的.sparkStaging下两个jar包都会保存下来。

然后再运行,发现HDFS上.sparkStaging目录下不会再保留jar包。

问题定位

按道理来说,因为spark.yarn.preserve.staging.files默认是false,所以HDFS上的jar包是不会被保留的。但是在spark1.0.2中,却没有删除。我看了下1.0.2的代码,删除的机制是存在的:

//yarn/alpha/src/main/scala/org/apache/spark/deploy/yarn/ApplicationMaster.scala 

[java] view plain copy
  1. /** 
  2.    * Clean up the staging directory. 
  3.    */  
  4.   private def cleanupStagingDir() {  
  5.     var stagingDirPath: Path = null  
  6.     try {  
  7.       val preserveFiles = sparkConf.get("spark.yarn.preserve.staging.files""false").toBoolean  
  8.       if (!preserveFiles) {  
  9.         stagingDirPath = new Path(System.getenv("SPARK_YARN_STAGING_DIR"))  
  10.         if (stagingDirPath == null) {  
  11.           logError("Staging directory is null")  
  12.           return  
  13.         }  
  14.         logInfo("Deleting staging directory " + stagingDirPath)  
  15.         fs.delete(stagingDirPath, true)  
  16.       }  
  17.     } catch {  
  18.       case ioe: IOException =>  
  19.         logError("Failed to cleanup staging dir " + stagingDirPath, ioe)  
  20.     }  
  21.   }
按照这个逻辑,默认在AM关闭的时候,是会删除HDFS上的jar包的。不过没有正常删除。推测这应该是一个1.0.2里面的bug,而在1.1.0里面已经修复。


nodemanager节点上的jar包缓存

升级到1.1.0版本后,HDFS上的jar包问题就解决了。但是nodemanager节点上的jar包还是会保留。这个问题的定位很纠结,不过结果却出乎意料的简单。不说了,上结果吧。

配置方法

(1) 配置yarn-site.xml:
<span style="font-family:Microsoft YaHei;font-size:12px;"> <property>
<name>yarn.nodemanager.local-dirs</name>
<value>local-dir1, local-dir2,local-dir3</value>
</property>
<property>
<name>yarn.nodemanager.localizer.cache.target-size-mb</name>
<value>1024</value>
</property>
<property>
<name>yarn.nodemanager.localizer.cache.cleanup.interval-ms</name>
<value>1800000</value>
</property></span>
**yarn.nodemanager.local-dirs: 这个目录是nodemanager上的作业中间数据存放路径。推荐配置多个盘上的多个路径,从而分散作业执行中的磁盘IO压力。
**yarn.nodemanager.localizer.cache.target-size-mb:配置nodemanager上的缓存目录的最大限度。nodemanager上有一个deletion server服务,会定期检测,如果yarn.nodemanager.local-dirs中配置的目录大小(如果配置了多个,则计算多个目录的总大小)是否超过了这里设置的最大限度值。如果超过了,就删除一些已经执行完的Container的缓存数据。
因为spark提交作业后遗留在nodemanager上的jar包就在yarn.nodemanager.local-dirs下面,所以只要这里配置合适的大小值。那么nodemanager上的deletion server是会自动检测并保证目录总大小的。所以只要配置了这个量,我们就不需要再担心nodemanager上的jar包缓存问题了,交给yarn就好了!很简单啊有木有,可就这么个问题,居然花了我一个星期的时间去定位。
**yarn.nodemanager.localizer.cache.cleanup.interval-ms: deletion server多长时间做一次检测,并且清除缓存目录直到目录大小低于target-size-mb的配置。
通过上面这三个量的配置,nodemanager会确保本地的缓存数据总量在target-size-mb之下,也就是超过了的话,之前的spark的jar包就会被删除。所以我们就不需要再担心nodemanager节点上的spark jar包缓存问题了。不过target-size-mb的默认值是10G,这个值当然可以根据你的实际情况进行调整。

问题定位

为什么mapreduce提交的任务在执行完后,会自动删除nodemanager上的所有中间文件,而spark却不会呢?

查看了下Hadoop的源码(相关代码就不贴出来了),MapReduce提交作业的时候,中间数据是以application file对象的方式被处理的,也就是在nodemanager上是存放在username/appcache/目录下的,而按照yarn的处理机制,application file是专门存放中间数据的对象,所以MapReduce作业的所有中间数据在作业执行完后会被yarn删除。

而spark on yarn的任务提交后,两个jar包却是以yarn的分布式缓存(distributed cache)的方式存放和处理的。Distributed Cache是yarn提供给用户用来分发和管理作业执行中用到的extra file的处理机制。spark没有调用yarn的application file对象,却提交成distributed cache类型,不知道为什么。不过这就是jar包最终没有被自动删除的原因。

下面是MapReduce任务提交后nm上分发中间文件的日志:


可以看到中间文件都被下载到appcache的目录下。

再看看spark任务提交后nm上分发jar包的日志:


很明显jar包被存放在filecache目录下。也就是它是作为distributed cache的方式分发到nm上的。不知道为什么spark采用这样的设计方式。file cache在作业结束后,是不会主动被删除的。


就是这样了,这个问题其实根本也算不上一个问题。也就是一个深入学习spark on yarn的架构和解惑的过程。

更新:spark采用file cache而不是application cache的原因,是因为spark在每个NM上启动的是一个executor,每个task作为executor里的一个线程在运行。而只需要在executor启动时,在这个节点上用file cache机制分发一次jar包,然后在每个task执行时,能共享到通过file cache传过来的jar包。所以采用file cache机制的原因,是要在task之间共享jar包。


http://blog.csdn.net/amber_amber/article/details/42081045

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