networkx库:AttributeError: 'module' object has no attribute 'graphviz_layout'

来源:互联网 发布:企业电话查询软件 编辑:程序博客网 时间:2024/06/06 10:51
  • 1.起因
    在学习用python处理自然语言时,遇到借用networkx绘图来描述词语上下位关系的小练习,于是尝试,电脑win10环境,anaconda函数库包,自带networkx库,pycharm的集成环境,利用命令行运行如下代码:
import networkx as nxG=nx.complete_graph(5)nx.draw_graphviz(G)

如果使用nx.draw(G)没问题,这里会报错:AttributeError: ‘module’ object has no attribute ‘graphviz_layout’,问题的原因解析可以参考http://stackoverflow.com/questions/35279733/what-could-cause-networkx-pygraphviz-to-work-fine-alone-but-not-together

  • 2.解决

该问题引起肯定是缺失必须的工具软件包,一番探索后发现,以下几个软件工具包必须完整安装:

  • graphviz软件:http://www.graphviz.org/(path路径必配)
  • networkx模块:https://networkx.readthedocs.io/en/stable/overview.html
  • pygraphviz模块:连接graphviz与networkx的API接口(必备)

其中,前俩样安装问题不大,主要集中在pygraphviz的安装问题

  • windows下安装pygraphviz
    直接上pypi下载pygraphviz源码包,解压后install后报错,提示安装VC++ for python的控件:https://www.microsoft.com/en-us/download/confirmation.aspx?id=44266;

    然后,继续尝试安装,预装的anaconda环境会干扰setup.py的目录搜索,继续报错,最终发现在setup.py中可以配置如下两个参数:

    include_dirs=[“D:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\include”],
    library_dirs=[“D:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\lib\release\lib”],

    其中注意均使用32位的系统及工具,其次确保graphviz软件路径的正确性。

    最后千万记住的是:先使用python setup.py build命令运行,然后使用python setup.py install命令安装,忽视前面总会不停的报错Nonetype…,没报错基本安装正确,可以使用pygraphviz/example下面的simple.py示例运行检测效果。

  • 3.测试

import networkx as nxfrom matplotlib import pyplot as plt#版本升级后需要显示导入nexworkx的函数,例如graphviz_layoutfrom networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layoutG = nx.complete_graph(5)pos = graphviz_layout(G)nx.draw(G, pos)plt.show()

图形如下:
这里写图片描述

  • 注意:如果使用networkx中的draw_graphviz仍然会报错AttributeError: ‘module’ object has no attribute ‘graphviz_layout’,这里在于版本中graphviz_layout位于nx.drawing.nx_graph层级下,而1.11中代码调用存在于nx.drawing.graphviz_layout
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