在Ubuntu中安装Circos

Circos是一个功能强大的数据和信息可视化工具，这好像是我迄今为止见到的最难安装的软件，折腾了半天才安装成功。

在Ubuntu中安装，首先要按照其网站上的说明进行如下操作：
tar xvfz circos-x.xx.tgz
cd circos-x.xx
Now either change the first line in scripts in bin/* and tools/*/bin to
#!/usr/bin/env perl
or (better) make a symlink from /usr/bin/env to /bin/env
sudo su
cd /bin
ln -s /usr/bin/env env

然后还要安装下面这些Perl模块，以Config::General为例，安装方法是：
sudo perl -MCPAN -e shell
cpan> install Config::General

Carp
Config::General
Cwd
Data::Dumper
Digest::MD5
File::Basename
File::Spec::Functions
File::Temp
FindBin
Font::TTF::Font
GD
GD::Image
GD::Polyline
Getopt::Long
IO::File
List::MoreUtils
List::Util
Math::Bezier
Math::BigFloat
Math::Round
Math::VecStat
Memoize
Params::Validate
Pod::Usage
POSIX
Readonly
Regexp::Common
Set::IntSpan
Storable
Sys::Hostname
Text::Format
Time::HiRes

安装这些模块过程中，GD，GD::Image及GD::Polyline这些模块比较麻烦，总是提示安装失败。
退出cpan
cpan> q
安装libgd-gd2-noxpm-perl
sudo apt-get install libgd-gd2-noxpm-perl

然后删除～/.cpan/build这个文件夹中所有以GD开头的文件和文件夹

重新进入cpan，继续安装perl模块即可。

这玩意儿虽然比较难安装，但作出来的图的确是相当漂亮的！

本文转载自有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]