蛋白PDB文件格式

列 

数据类型

字段名称 

定义描述

1 - 6 

Record name

"DBREF "

8 - 11

IDcode 

idCode 

记录的ID号

13 

Character

chainID 

链的标识符

15 - 18 

Integer 

seqBegin 

PDB序列片段的起始序列号

19 

AChar 

insertBegin

PDB序列片段的起始插入代码

21 - 24 

Integer 

seqEnd

PDB序列片段的终止序列号

25 

AChar 

insertEnd 

PDB序列片段的终止插入代码

27 - 32 

LString

database

序列数据库名称如PDB，SWS，当一个相应的序列数据库记录还未识别时即存放PDB

34 - 41 

LString

dbAccession 

序列数据库的访问号码，如对于GenBank来说即是NCBI gi

43 - 54 

LString

dbIdCode 

序列数据库的识别密码，对GB来说即是访问号码

56 - 60 

Integer 

dbseqBegin 

数据库片段的起始序列号

61 

AChar 

idbnsBeg 

涉及到PDB的话，存放片段起始残基的插入代码

63 - 67

Integer 

dbseqEnd 

数据库片段的终止序列号

68 

AChar 

dbinsEnd 

涉及到PDB的话，存放片段终止残基的插入代码。

---

原文出自：蛋白质PDB文件说明.doc

英文版：PDB Primary Structure Section

---

from:Valeri Barsegov Molecular Dynamics Simulations: Lecture 16 & 17

转自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6264e0aa0102edyr.html