VMware下CentOS MPI并行计算环境搭建

来源：互联网发布：vb sqlite3 编辑：程序博客网时间：2024/05/05 05:06

不得不吐槽一下，我刚开始用的CentOS 7搭了好几天不是这里错就是那里错，然后我觉得可能是系统与mpich2不兼容，于是就换了CentOS 5，但是发现出现同样的问题。主要出现的问题是能够启动节点的mpd，但是mpdtrace和mpdallexit命令执行会出错。思来想去，之前好像误打误撞能够执行这两个命令（但那时候不能运行双节点），那时候mpich2不是在root下安装的，于是我觉得是root安装的问题，果不其然，在非root用户下弄好了，真是心累！废话不多说，说下过程，以免以后要搭的时候又出bug，也给大家一个参考。

环境说明

VMware Workstations Pro下的两台CentOS 5.5虚拟机

配置虚拟机的静态ip及修改hostname

配置静态IP（这是在已经建立虚拟机之后）
不想写太多文字，直接贴图
![Alt text](http://img.blog.csdn.net/20170206130611593?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvbHZteTM=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)
把VMnet8中的“使用本地DHCP…”勾掉，子网自己可以设，我是用默认的，然后“应用”

进虚拟机后，应该是上不了网，此时就要配置/etc/sysconfig/network-scrips/ifcfg-eth0,随便你用什么编辑该文件，笔者直接用gedit（boot下）,修改如下（可能你的跟我的不太一样，但是大同小异）：
DEVICE=eth0
BOOTPROTO=static
IPADDR=192.168.253.5
NETMASK=255.255.255.0
HWADDR=00:0C:29:EE:09:04#这一行为默认，如果克隆虚拟机则需要求改
ONBOOT=yes
DNS1=192.168.253.2#这一行与默认网关相同，可在虚拟网络编辑器的VMnet8的nat设置中查看
修改/etc/sysconfig/network文件如下
NETWORKING=yes
NETWORKING_IPV6=no
HOSTNAME=C1#主机名，修改hostname需要
GATEWAY=192.168.253.2#默认网关
然后重启网络（命令：service network restart)，现在应该就可以上网了。
修改hostname
除了上面修改的/etc/sysconfig/network外，还要修改/etc/hosts，如下：
#127.0.0.1 localhost.localdomain localhost#这一行最好注释掉，反正应该不会有很大影响
192.168.253.5 C1#网卡ip hostname
192.168.253.6 C2
::1 localhost6.localdomain6 localhost6
这里要说明的是我加了两行C1和C2，这是为了。。额忘了，是为了ping C2能对应上ip。重启后应该就能生效！艾玛本来不想写这部分，累死我了。

SSH无密码登录配置

接下来是比较重要的一环了，这关系到多节点的mpd启动。
1.在每个节点上执行ssh-keygen -t rsa命令，之后直接回车就可以
2.在每个节点上执行cat ~/.ssh/id_rsa.pub | ssh mlv(用户名，每个节点相同)@C1（你设的hostname） “cat - >> ~/.ssh/authorized_keys” ，这一步生成authorized_keys
3.在每个节点上执行scp mlv@C1:~/.ssh/authorized_keys ~/.ssh/,这一步把authorized_keys复制到各节点的/.ssh目录
4.权限设置chmod 600 ~/.ssh/authorized_keys
现在就可以无密码登陆了！ssh c2试下！如果觉得我没说清楚，可以参考：http://www.cnblogs.com/marsprj/archive/2013/02/26/2933839.html

安装mpich2（每个节点都要）

1.下载mpich2，百度一下就有了，我下的1.4.1p1版
2.如果没有GCC，要先安装不然下面出问题，命令：yum install gcc* -y
3.安装随便你实在root还是在非root下，我是在root下好像，执行以下命令:
tar zxvf mpich2-1.4.1p1.tar.gz
cd mpich2-1.4.1p1
./configure –prefix=/opt/mpich2-1.4.1p1 –with-pm=hydra:mpd –with-mpe
make && make install
4.我退回到非root用户下配置环境变量，修改~/.bashrc，添加下面一行PATH=”$PATH:/opt/mpich2-1.4.1p1/bin”，然后运行source ~/.bashrc就可以了。
5.不放心的话可以测试一下：which mpd如果有路径则说明成功了。
6.创建配置文件mpd.conf
由于我是普通用户，所以应创建~/.mpd.conf，内容为secretword=123456，这个值可以自己设，但是每个节点上的该文件内容要相同。
7.创建配置文件~/mpd.hosts,其内容为每一行对应一个hostname
8.在各个节点搞完上面的，应该就可以启动mpd了，单节点启动（本机）：mpd &，多节点启动：mpdboot -n 2(节点数) -f ~/mpd.hosts，查看运行节点:mpdtrace -l，关闭所有:mpdallexit.
然后就可以运行程序了，注意如果要在各个节点上运行的话要指明host，比如我要在C1,C2运行，则要执行以下命令mpirun -hosts C1,C2 -n 2 ./cpi。OK，大功告成!

不行的话参考下，下面的吧，我是东拼西凑搞出来的，如果没说清楚还请见谅！
参考网站：
http://www.cnblogs.com/marsprj/archive/2013/02/26/2933906.html
http://www.cnblogs.com/marsprj/archive/2013/02/26/2933839.html
http://www.doc88.com/p-9899788704360.html

0 0