TreeFam数据库
来源:互联网 发布:网络短信群发免费版 编辑:程序博客网 时间:2024/05/17 09:34
TreeFam: Home page http://www.treefam.org/
[博士论文] Treefam数据库的建立_百度文库 http://wenku.baidu.com/link?url=4NR5N6TwlUyynORtiK_FrXkxPMQbm5BxKBYOx5cdSDOCWxXAuE24Dr3nrEcifgcJkHSFAf0Ihl8SBtfFDXEmAepSe3ya8icaHv1POePu3AK
算法:
1.约束邻接法:高效重构整个进化树而不改变子树的拓扑结构 可保留人工校正结果
2.叶节点重排算法:保证叶节点以接近指定的顺序在平面排列 可让相似的树实现相似的平面视觉效果
3.推断基因倍增和缺失算法:物种树多分岔的情况
4.树合并算法:结合多棵从同一序列集构造的基因树 通过减少可推断出倍增,缺失事件和选择较高的自展支持 构建出一棵超越所有备选树的最优树
简约法和最大似然法不能取代距离法
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