Mac osx 10.12 下安装cadnano

请使用vpn

1，安装之前先解决unable to access ‘https://github.com/Homebrew/brew/‘: Failed to connect to github.com，避免安装失败

参见http://blog.csdn.net/u010599923/article/details/58210145

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1.1 获取ip,并copy

$ ping github.com

1.2在／etc／hosts中增加ip

$ sudo vi etc/hosts

输入用户密码
打开之后在文件添加获取的ip

:wq

保存退出

2，安装homebrew

/usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"

直至installation successful
如果出现其他问题，参见点击打开链接

2.2 安装成功之后，可能会出现使用brew，有command not found的问题

两种解决方法

1, 每次brew之前

$ /usr/local/bin/brew doctor

2,更改bash_profile打开文件

$ sudo vi ~/.bash_profile

加入

export PATH=/usr/local/homebrew/bin:$PATH:wq

回到终端输入，使文件生效。

source ~/.bash_profile

3,安装python3

参见http://www.iosxxx.com/blog/2015-12-24-brewan-zhuang-python.html

sudo mv /usr/bin/python /usr/bin/python2

出现Operation not permitted,解决办法：
Mac重新开机，command+R进入恢复模式，打开terminal

csrutil disable

重新启动，按照上述链接重新安装。
安装完成之后，Mac重新开机，command+R进入恢复模式，打开terminal

csrutil enable

重新启动，python安装完成。

4,安装PyQt5

$ pip3 install PyQt5

5，装cadnano

$ pip3 install "Git+https://github.com/cadnano/cadnano2.5"

地址如有更新自行更换即可。
cadnano安装成功之后，键入下行，后者每次从terminal中启动。

$ python setup.py install$ cadnanoinstall

完成。

注：安装完成的cadnano有很多bug，如果有人找到了补丁文件，请告知，谢谢