洛谷 P1140 相似基因
来源:互联网 发布:虚拟linux系统界面 编辑:程序博客网 时间:2024/06/06 07:18
洛谷 P1140 相似基因
题目
题目背景
大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。
在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。
题目描述
两个基因的相似度的计算方法如下:
对于两个已知基因,例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基-,例如:
这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:
那么相似度就是:(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:
相似度为:(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。
输入输出格式
输入格式:
共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含A,C,G,T四个字母。1<=序列的长度<=100。
输出格式:
仅一行,即输入基因的相似度。
输入输出样例
输入样例#1:
7 AGTGATG5 GTTAG
输出样例#1:
14
题解
DP,f[i][j]表示a[i]与b[j]匹配时的最优解
转移方程自然就有三个:
f[i][j]=max(f[i][j],f[i-1][j]+val[a[i]][4]);//表示a[i]与空碱基匹配f[i][j]=max(f[i][j],f[i][j-1]+val[b[j]][4]);//表示b[i]与空碱基匹配f[i][j]=max(f[i][j],f[i-1][j-1]+val[a[i]][b[j]]);//表示a[i]与b[i]匹配
代码
#include<cstdio>#include<iostream>using namespace std;int n,m,ans;int a[105],b[105],f[105][105];int val[5][5]={ {5,-1,-2,-1,-3}, {-1,5,-3,-2,-4}, {-2,-3,5,-2,-2}, {-1,-2,-2,5,-1}, {-3,-4,-2,-1,0}};int max(int x,int y){ if (x>y) return x; else return y;}int main(){ char ch; cin>>n; for (int i=1;i<=n;i++) { cin>>ch; if (ch=='A') a[i]=0; else if (ch=='C') a[i]=1; else if (ch=='G') a[i]=2; else a[i]=3; } cin>>m; for (int i=1;i<=m;i++) { cin>>ch; if (ch=='A') b[i]=0; else if (ch=='C') b[i]=1; else if (ch=='G') b[i]=2; else b[i]=3; } for (int i=1;i<=n;i++) for (int j=1;j<=m;j++) f[i][j]=-1e9; for (int i=1;i<=n;i++) f[i][0]=f[i-1][0]+val[a[i]][4]; for (int i=1;i<=m;i++) f[0][i]=f[0][i-1]+val[b[i]][4]; for (int i=1;i<=n;i++) { for (int j=1;j<=m;j++) { f[i][j]=max(f[i][j],f[i-1][j]+val[a[i]][4]); f[i][j]=max(f[i][j],f[i][j-1]+val[b[j]][4]); f[i][j]=max(f[i][j],f[i-1][j-1]+val[a[i]][b[j]]); } } printf("%d",f[n][m]); return 0;}
阅读全文
1 0
- 洛谷 P1140 相似基因
- 洛谷 P1140 相似基因
- 动态规划 洛谷P1140 相似基因
- 落谷 P1140 相似基因
- 洛谷1140 相似基因
- 相似基因
- 相似基因序列
- 动归----相似基因
- luogu1140 相似基因
- 南邮 OJ 1502 相似基因
- 一、动态规划(1)相似基因
- POJ 1080 基因序列相似度计算 动态规划
- P1140 铺砖块
- 基因
- 基因预测
- 企业家基因
- 山寨基因
- 职业基因
- POJ-2752 Seek the Name, Seek the Fame
- JavaScript定时器原理及高级使用
- gdb多进程/多线程调试实战
- node 回调函数
- HbaseTemplate进阶:利用hbase.properties文件对Hbase的集群和端口进行配置
- 洛谷 P1140 相似基因
- CC26xx SPI
- Windows64 Py-Faster-RCNN的配置
- JSP&Servlet 监听器
- Vue之实例详解
- TTS开源方案open jTalk
- iOS编程基础-Swift(五)-流程控制与其他
- 千万级规模高性能、高并发的网络架构经验分享
- Lambda表达式全面了解——通俗易懂