Grading of Gliomas by Using Radiomic Features on Multiple Magnetic Resonance Imaging (MRI) Sequences
来源:互联网 发布:php微信开发实例 编辑:程序博客网 时间:2024/05/22 19:18
使用多种MRI序列中的影像特征对脑胶质瘤进行分级
背景:
- 神经胶质瘤是最常见的脑部肿瘤
- 常规MRI图像显示重叠会导致误诊
- 基于FLAIR T1-CE ADC序列的影像特征的合并进行分级
方法:
- 选取66个已经通过病理组织验证的脑胶质瘤患者,他们经过了T2-FLAIR 和 T1WI-CE扫描,其中63个还通过了DWI扫描
- 使用in-house软件通过影像组学方法提取了114个特征
- 所有特征在HGG和LGG两种级别下进行对比,选出具有显著统计差异的特征
- 评估具有显著差异的特征和胶质纤维酸性蛋白(GFAP)表达的关系
结果:
- 从三种MRI序列中选出8个具有显著统计差异的特征
- 把特征合并能提高精确率
- 发现了(GFAP)和T1-CE以及ADC之间有重要的联系
结论:
- 合并后的特征对于区分HGG与LLG有着更高的精确率
背景
根据世界卫生组的标准,脑胶质瘤分为四个等级,一级和二级为低级,三级和四级为高级。脑胶质瘤的分级准确度对治疗决策,化放疗的监测和管理以及预后评估有着重要的临床意义。Radiomics有优势也有三个缺点,1,处理数据麻烦,需要特定的步骤和软件,2,没有一个通用的标准,3,感兴趣区域的需要临床医生在图像中一层一层的画出来。以前的研究都是使用单一的序列和单一的特征,由于脑胶质瘤的异质性,使用多序列可能会更加有效。
数据和方法
病人的选择:66个在2012二月到2015十月之间接受MRI检查的病人,33为男性,年龄在22 73之间,平均年龄为51.5,有三位由于严重没有DWI序列。
影像数据获取:
肿瘤的分割:T2WI-FLAIR, T1WI-CE, 和 ADC maps序列的图像由具有经验的神经放射学家经过两次盲审,直到对肿瘤区域达到一个统一的意见。
数据处理:对于序列中的每一个切片中,如果有肿瘤,就用1表示,没有就用0表示,以这样的方式存到一个矩阵中,在矩阵中再加上切片序号,构成一个三维矩阵,所有的计算都在这个三为矩阵中实现。利用Aerts等的研究获取114个特征。
组织病理学:对65例神经胶质瘤进行总体切除,1例部分切除,除了对肿瘤进行分级外,还评估了GFAP的免疫组织化学(IHC)指数,计算细胞GFAP表达水平的平均值。
统计分析:使用SPSS软件进行统计分析。通过两个测试,在三个序列上的HGG和LGG对提取到的特征做比较。选出具有明显差异的特征,使用ROC曲线分析方法来确定那些具有显著特征的诊断能力。对这些特征进行归一化处理,然后将其合并成一个新的特征。对于每种序列上的影像特征和胶质瘤GFAP的IHC指数的关系的分析使用皮尔森相关系数方法,对于所有的统计测试,当P<0.056时,被认为是显著的。
特征的归一化和合并:使用z-score方法对特征进行归一化,使用第二个函数进行特征合并。
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结果
对于三个序列上所有的特征,在HGG和LGG之间进行比较。得到了2个T2WI-FLAIR序列上的特征,3个T1WI-CE序列上的特征,3个ADC map上的特征。
方差 能量 熵 同质性 平均值
对于三个序列上所有的特征,在 II, III, 和 IV级肿瘤之间进行比较
对于三个序列上所有的特征和合并后的特征,使用ROC曲线分析在HGG和LGG之间进行比较
GFAP和影响特征之间的关联性
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