nipype处理核磁数据(三)——MATLAB、SPM、ANTs、AFNI的安装

nipype处理核磁数据(三)——MATLAB、SPM、ANTs、AFNI的安装

都是基于虚拟机Linux系统的安装，我自己用的ubuntu

1.MATLAB   （安装不难，就是文件比较大，需要网好点的地方下载安装包，不然很崩溃。。。。）

第一步：下载安装包  建议下载的时候三个分开下，一个完成再下另一个，解压方便

下载地址：链接：http://pan.baidu.com/s/1pL83jBH密码：v914

第二步：解压安装包

rar格式：终端输入 rar x 文件路径+文件名（只用解压百度网盘中下载下来的Part1,在解压1的同时2也会解压，最后形成一个.iso文件）

zip格式：终端输入 unzip 文件路径+文件名（这个主要针对的是crack文件）

第三步：挂载

在终端执行命令;

sudo mkdir /media/matlalbsudo mount -o loop [j最终.iso文件的文件路径+文件名]MATHWORKS_R2014A.iso /media/matlabcd /media/matlabsudo ./install

第四步：安装

在运行完上述代码后，操作基本和windows中一样了。

在出现的图形用户界面上选择“使用秘钥安装”，安装秘钥在crack文件夹中的readme.txt中。

第五步：激活

根据提示选择“不使用互联网手动激活”，,lic文件选择使用crack文件夹中的license_405329_R2014a.lic

再利用终端将crack文件夹中的libmwservices.so复制到安装目录下，这里我使用的代码为

sudo cp /home/username/downloads/matlab2014/Crack/Linux/libmwservices.so /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64

完成这一步就可以使用了，再终端输入sudo matlab即可。

！！！一定有sudo，权限这个版本我也不知道什么原因改不过来，只能用sudo启动。。。

第六步：安装支持包

在终端输入 sudo apt-get install matlab-support ,安装后提示的安装路径是MATLAB的，不用改，用户权限不填，GCC选否。

第七步：配置环境变量

调出.bashrc文件，在文档后添加下列代码，保存。

#MATLABexport PATH=/usr/local/MATLAB/R2014a/bin:$PATHexport MATLABCMD=/usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/MATLAB

2.SPM

下载地址：http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/download/

解压： 因为SPM是依赖于MATLAB的，所以在安装好MATLAB的基础上才可以进行这一步。

sudo unzip spm12 路径+文件名 -d /usr/local/MATLAB/R2014a/toolbox

配置环境变量，打开.bashrc文档，在文档末尾添加

#SPM12export SPM_PATH=/usr/local/MATLAB/R2014a/toolbox/spm12/

在MATLAB中添加环境变量

在MATLAB中输入 spm fmri ， 出现spm界面即安装成功。

3.ANTs

下载网址：https://github.com/ANTsX/ANTs/releases

用之前介绍的办法sudo cp.......将下载文件复制并解压到/usr/local文件夹下

打开.bashrc文件，在文档末尾添加

#ANTsexport PATH=/usr/local/antsbin/bin:$PATHexport ANTSPATH=/usr/local/antsbin/bin

4.AFNI

在安装好NeuroDebian的基础上，直接在终端运行

sudo apt-get install afni

打开.bashrc文件，在文档末尾添加：

#AFNIexport PATH=/usr/lib/afni/bin:$PATH