DNA片段装配算法
来源：互联网 发布：阿里云天池大数据竞赛 编辑：程序博客网 时间：2024/04/30 06:40
一、步骤
交叠-查找潜在的交叠片段
排列-查明片段的顺序
共有-从排列中导出DNA片段
二、具体：
交叠问题：查找一个序列的后缀和另一个序列的最好的匹配。但由于测序误差问题，在序列联配中使用修改的动态规划算法。由于误差较小，可采取过滤方法,过滤掉成对的不共享一个显著的公共子串的片段。
排列问题：确定2个片段是否是真的交叠的，还是来自一个重复体的2个不同的拷贝。
片段装配问题：校正序列读出片段的误差
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