后缀数组简单总结

来源:互联网 发布:golub 矩阵计算 pdf 编辑:程序博客网 时间:2024/06/05 01:00

后缀数组就是将字符串所有后缀排序后的数组,设字符串为S,令后缀Suffix(i)表示S[i..len(S)]。用两个数组记录所有后缀的排序结果:

  • Rank[i]记录Suffix(i)排序后的序号,即Suffix[i]在所有后缀中是第Rank[i]小的后缀
  • SA[i]记录第i位后缀的首字母位置,即Suffix[SA[i]]在所有后缀中是第i小的后缀
然后就是怎么快速求所有后缀的顺序了,其中的关键是如何减少两个后缀比较的复杂度
方法是倍增法,定义一个字符串的k-前缀为该字符串的前k个字符组成的串,关于在k-后缀上的定义Suffix(k,i)、SA[k,i]和Rank[k,i]类似于前,则有
  • 若Rank[k,i]=Rank[k,j]且Rank[k,i+k]=Rank[k,j+k],则Suffix[2k,i]=Suffix[2k,j]
  • 若Rank[k,i]=Rank[k,j]且Rank[k,i+k]<Rank[k,j+k],则Suffix[2k,i]<Suffix[2k,j]
  • 若Rank[k,i]<Rank[k,j],则Suffix[2k,i]<Suffix[2k,j]
这样就能在常数时间内比较Suffix(2^k, i)之间的大小,从而对Suffix(2^k,i)时行排序,最后当2^k>n时,Suffix(2^k, i)之间的大小即为所有后缀之间的大小

于是求出了所有后缀的排序,有什么用呢?主要是用于求它们之间的最长公共前缀(Longest Common Prefix,LCP)

令LCP(i,j)为第i小的后缀和第j小的后缀(也就是Suffix(SA[i])和Suffix(SA[j]))的最长公共前缀的长度,则有如下两个性质:
  1. 对任意i<=k<=j,有LCP(i,j) = min(LCP(i,k),LCP(k,j))
  2. LCP(i,j)=min(i<k<=j)(LCP(k-1,k))
第一个性质是显然的,它的意义在于可以用来证明第二个性质。第二个性质的意义在于提供了一个将LCP问题转换为RMQ问题的方法:
令height[i]=LCP(i-1,i),即height[i]代表第i小的后缀与第i-1小的后缀的LCP,则求LCP(i,j)就等于求height[i+1]~height[j]之间的RMQ,套用RMQ算法就可以了,复杂度是预处理O(nlogn),查询O(1)

然后height的求法要用到另一个数组:令h[i]=height[Rank[i]],即h[i]表示Suffix(i)的height值(同时height[i]就表示Suffix(SA[i])的height值),则有height[i]=h[SA[i]]
然后h[i]有个性质:
  • h[i] >= h[i-1]-1
用这个性质我们在计算h[i]的时候进行后缀比较时只需从第h[i-1]位起比较,从而总的比较的复杂度是O(n),也就是说h数组在O(n)的时间内解决了。求出了h数组,根据关系式height[i]=h[SA[i]]可以在O(n)时间内求出height数组,于是可以在O(n)时间内求出height数组,从而整个LCP问题就解决了^_^

然后后缀数组的应用就是利用它的LCP在需要字符串比较时降低复杂度。同时由于后缀数组的有序性可以很方便地使用二分

于是总结一下要点:
  • 利用倍增算法在O(nlogn)的时间内对后缀数组进行排序
  • 利用h数组的性质在O(n)的时间内求出储存排序后相邻后缀间的LCP数的组height
  • 利用LCP的性质将平凡LCP问题转化为height数组上的RMQ问题

本题是求两字符串的最长公告子串(注意是子串不是子序列),构造出SA,RA和HEIGHT后,答案就是最大的HEIGHT,但这个最大的HEIGHT可能是同一个串中的,

所以这个最大的HEIGHT同时要满足sa[i-1]和sa[i]不在同一个串中。

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