（转）使用Java和R搭建统计分析server端

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摘要：使用R搭建统计分析服务器，Java通过TCP/IP协议来与R服务器交互，输入分析数据及参数，获得统计分析结果。

步骤：
1. 搭建Rserve服务器，从而可以监听统计分析请求
参考文章：R与JAVA的整合 （http://www.lijian001.com/r/blog_comment.asp?article_id=199）
安装 R ：$ sudo apt-get install r-base
启动并进入R环境：$ R
安装Rserve包：> install.packages("Rserve")
加载Rserve包：> library("Rserve")
启动Rserve(默认为demon方式启动): > Rserve

至此R这一端的准备工作已经就绪，Rserve启动后即使用q()退出R环境，Rserve也依旧运行。

2. 下载Rserve的jar包，这样可以直接调用已经做好的API，而不需要纠缠于R端的TCP/IP协议
地址：http://www.rforge.net/Rserve/files/
jar包共有两个:REngine.jar和RserveEngine.jar，目前还没弄清楚为什么不能把API放到一个jar包里来方便部署。

3. 编写Java代码来调用Rserve
最简单的几个调用方法：
//将数组赋值给某个变量
RConnection.assign("dataA", arrayObject);

// 此处dataA和dataB为两个数组变量名，这一语句将对dataA和dataB两组数据进行t检验，并返回R端相应的console输出。
RConnection.eval("paste(capture.output(print(t.test(" + dataA + "," + dataB + "))),collapse=\"\\n\")").asString()

//还可以将R中的plot图片导到Java中来，下面代码中返回的byte数组对象可以通过FileOutputStream来输出到一个jpg文件。这段代码应该还有不少可以优化的地方，但是我一时找不到tmp.jpg的存放路径，只好作罢：
    public static byte[] boxplot(RConnection c, String dataAName, String dataBName) throws REXPMismatchException, REngineException{
        String device = "jpeg";

        REXP xp = c.parseAndEval("try(" + device + "('tmp.jpg',quality=90))");
        c.parseAndEval("boxplot(" + dataAName + "," + dataBName + "); dev.off()");
        xp = c.parseAndEval("r=readBin('tmp.jpg','raw',1024*1024); unlink('tmp.jpg');r");

        return xp.asBytes();
    }



后记：还有一种搭建方式是利用R本身的动态链接库来直接调用分析方法，我个人偏好client/server这种方式，因为感觉这样分层清晰，一旦出问题了也容易定位bug。