Jbrowse中的BigWig Tracks配置

来源:互联网 发布:少数民族人脸数据库 编辑:程序博客网 时间:2024/06/05 02:26


上述图中,红色箭头所指的是bigwig文件,缩写是bw文件.【bigwig文件可以通过bedGraph文件转化得到】

基因浏览器有两种方式来解析数据构成bigwig trace

<1>直接读取bigwig类型的文件

<2>通过perl脚本解析bedGraph类型的文件

在jbrowse下执行   【bin/wig-to-json.pl --wig  data_files/巩膜-4周-差异甲基化.bedGraph --tracklabel sclera】命令,但是如果数据量太大的话,这种方式不建议使用。


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