Ubuntu15.04+caffe+cuda+cudnn+matlab

本文地址：http://blog.csdn.net/xuhang0910/article/details/50179759

9月份决定要搭建深度学习的环境，一直到现在搭建好caffe，。

1.开讲前的废话

以下纯属吐槽，是废话，大家可略过：

8月份，老师让我搞深度学习，一开始我是拒绝的，因为我觉得它好难啊，这么高大上的东西我一个小白怎么搞，无奈老师的话还是要听的，硬着头皮搞，但当时只想着回家，也没有正儿八经弄就随便弄了个windows下的theano糊弄过去了，开学后不得不收拾烂摊子，从选择深度学习的框架theano、caffe、torch。经过我精挑细选最终选择了caffe。

漫长的征程开始了，先准备在windows下弄，搞了半天没弄出来，so放弃，接着改在Ubuntu下弄，由于第一次装双系统，没经验，把我的笔记本搞坏了，遇到种种问题（怎么直接进入Ubuntu了，windows进不去了，说好的双系统呢；经过一番折腾。。。嗯，终于进入windows了，嗯？怎么不能上网了，为什么ubuntu下能上网而windows上不了呢；经过一番折腾。。。嗯，windows终于可以上网了，现在开始使用ubuntu吧）第一次接触Linux系统，完全不熟悉，这TM是啥，这个怎么安装，这个怎么用，感觉不如windows，so又放弃了。随后在老师的强制要求下继续使用熟悉linux系统。好吧。先试着安装cuda吧，嗯。。。竟然还要卸载驱动，还要关闭tty什么的，没办法，搞吧。wc，怎么ubuntu登陆后分辨率变模糊了，经过一番折腾。。。更新下驱动弄好了；继续搞，怎么出现花屏了，经过一番折腾。。。；继续搞，怎么ubuntu出现循环登录了，MGJ，继续搞。期间各种重装系统啊，感觉一学期都在重装系统啊，由于没备份，我笔记本里的东西早没了，同学们切记要有经常备份的习惯啊。感觉心好累，经过1个月左右的适应，总算对ubuntu有个基本了解了，现在安心装caffe吧。

你以为这样就完了吗，NO，安装caffe也是各种问题，差不多就是一步一个error，步步惊心啊，我的心情是崩溃的。

没办法，继续搞，从失败中总结教训，出错就google（某度就是渣渣），在qq群里问，最后换了ubuntu15.04，cuda7.5才成功的。

好了，废话说完了，让我们开始把。

百度云链接链接：http://pan.baidu.com/s/1numfgTz 密码：4jbz

2.Linux的安装

这里不详细说明，网上有很多，只是提几点需要注意的问题。

根分区： \ 100G，

Swap交换分区：128G ，这里设置成内存的1.5-2倍

boot分区：200M

Home分区：剩余的空间，建议300G以上。

安装完后软件更新器会提示让你更新，建议更新一下。

然后命令行输入，安装一些东西

sudo apt-get update sudo apt-get install git vim cmake automake

如果是Linux新手，不建议直接安装caffe，建议先熟悉一下Linux系统，掌握基本操作及关键命令如vim cd等等。

3.CUDA的安装（.deb方法）

直接去Nvidia的官网下载cuda7.5的ubuntu15.04 的deb(local)版，大概1.9G.

输入以下3行代码即可

sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1504-7-5-local_7.5-18_amd64.deb`sudo apt-get update`sudo apt-get install cuda`

我还安装了nvcc编译器，因为要写cuda程序

命令行输入

nvcc --version

按照提示安装即可。

4.Matlab的安装

matlabR2014a不好找，找不到的可以去开头的百度云链接下载，part1和part2都要下载，然后解压part1就行了

Mathworks.Matlab.R2014a.Unix.iso,右键 - 使用磁盘映像挂载器打开”，进入装载的虚拟光盘，拷贝全部文件至home/Matlab 文件夹

复制Crack/install.jar至 home/Matlab/java/jar/ 并覆盖源文件

$ sudo cp install.jar /home/Matlab/java/jar/</span>

 授权安装文件夹

$ chmod a+x Matlab -R

安装

$ sudo ./install 

选项：不使用Internet安装，建议把网线拔掉

序列号：XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX

默认路径：/usr/local/MATLAB/R2014a

勾选从默认启动路径创建符号链接（实现在任意位置运行matlab启动程序）

激活文件：license_405329_R2014a.lic

拷贝 libmwservices.so 至 /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64

$ sudo cp libmwservices.so /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/

解决编译器gcc/g++版本问题。

因为Ubuntu 15.04的gcc/g++版本是4.9.2，而Matlab 2014a（2015a）的版本是4.7.x所以在使用matla调用mex文件的时候，基本上都会报错，根据报错信息，考虑如下两步解决方案。

降级安装gcc/g++版本为4.7.x

(a). 下载gcc/g++ 4.7.x

$ sudo apt-get install -y gcc-4.7$ sudo apt-get install -y g++-4.7

(b). 链接gcc/g++实现降级

$ cd /usr/bin

$ sudo mv gcc gcc-4.9.2
$ sudo ln -s gcc-4.7 gcc
$ sudo mv g++ g++-4.9.2
$ sudo ln -s g++-4.7 g++

4.安装BLAS（此处为Intel的MKL）

这里可以选择（ATLAS，MKL或者OpenBLAS），我这里使用MKL，首先下载并安装英特尔® 数学内核库 Linux* 版MKL(Intel(R) Parallel Studio XE Cluster Edition for Linux 2016)，下载链接是：https://software.intel.com/en-us/intel-education-offerings， 使用学生身份（邮件 + 学校）下载Student版，填好各种信息，可以直接下载，同时会给你一个邮件告知序列号。下载完之后，要把文件解压到home文件夹(或直接把tar.gz文件拷贝到home文件夹,）

$ tar zxvf parallel_studio_xe_2016.tar.gz$ chmod a+x parallel_studio_xe_2016 -R$ sh install_GUI.sh

然后按照提示操安装即可，

MKL与CUDA的环境设置

1. 新建intel_mkl.conf， 并编辑之：

$ sudo gedit /etc/ld.so.conf.d/intel_mkl.conf

文件中输入

/opt/intel/lib/intel64
/opt/intel/mkl/lib/intel64

2. 新建cuda.conf，并编辑之：

$ sudo gedit /etc/ld.so.conf.d/cuda.conf

文件中输入

/usr/local/cuda/lib64
/lib

3. 完成lib文件的链接操作，执行：

$ sudo ldconfig -v

5.安装opencv3.0

这里使用的是欧新宇提供的opencv

sudo apt-get install libgstreamer1.0-dev  libgstreamer-plugins-base1.0-dev

切换到文件保存的文件夹，然后安装依赖项：

$ sudo sh Ubuntu/dependencies.sh

3. 切换目录Ubuntu\3.0\安装OpenCV 3.0.0：

$ sudo sh opencv3_0_0.sh(或者选择-rc1.h)

保证网络畅通，因为软件需要联网这里时间较长，请耐心等待。。。，

完成后测试一下，写个opencv程序linux下编写opencv测试一下

6.安装依赖项

安装Google Logging Library（glog），下载地址：https://code.google.com/p/google-glog/，然后解压安装：

$ tar zxvf glog-0.3.3.tar.gz$ ./configure$ sudo make$ sudo make install

安装其他依赖项，确保都成功

$ sudo apt-get install -y libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-devlibopencv-dev libboost-all-dev libhdf5-serial-dev libgflags-dev libgoogle-glog-devliblmdb-dev protobuf-compiler protobuf-c-compiler

7.安装caffe

安装ipython提供caffe接口

 sudo apt-get install -y ipython-notebook pandoc

一个简单的使用iPython NoteBook生成的html的例子：examples_notebook.html  example_notebook.ipynb

安装pycaffe必须的一些依赖项：

$ sudo apt-get install -y python-numpy python-scipy python-matplotlibpython-sklearn python-skimage python-h5py python-protobuf python-leveldbpython-networkx python-nose python-pandas python-gflags Cython ipython

 安装配置nVidia cuDNN 加速Caffe模型运算

安装前请去先官网下载最新的cuDNN (cudnn-70-linux-x64-v3)。

转到解压好的cudnn目录

$ sudo cp include/cudnn.h /usr/local/include$ sudo cp lib64/libcudnn.* /usr/local/lib

链接cuDNN的库文件

$ sudo ln -sf /usr/local/lib/libcudnn.so.7.0.64 /usr/local/lib/libcudnn.so.7.0$ sudo ln -sf /usr/local/lib/libcudnn.so.7.0 /usr/local/lib/libcudnn.so$ sudo ldconfig -v

切换到Caffe-master的文件夹，生成Makefile.config配置文件，执行：

$ cp Makefile.config.example Makefile.config

 配置Makefile.config文件（仅列出修改部分）

a. 启用CUDNN，去掉"#"

USE_CUDNN := 1

b. 配置一些引用文件（增加部分主要是解决新版本下，HDF5的路径问题）

INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/includeLIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial

c. 启用Intel Parallel Studio XE 2016

BLAS := mkl

d. 配置路径，实现caffe对Python和Matlab接口的支持

PYTHON_LIB := /usr/local/lib

MATLAB_DIR := /usr/local/MATLAB/R2014a

c. 启用OpenCV 3.0, 去掉"#"

OPENCV_VERSION =3
d.应用python

WITH_PYTHON_LAYER :=1

配置Makefile文件（实现对OpenCV 3.x的支持）

打开Makefile，查找“Derive include and lib directories”一节，修改“LIBRARIES +=”的最后一行，增加opencv_imgcodecs

opencv_core opencv_highgui opencv_imgproc opencv_imgcodecs

在命令行中输入

export CUDA_VISIBLE_DEVICES=0

export MKL_CBWR=AUTO

 编译caffe-master！！！"-j8"是使用CPU的多核进行编译，可以极大地加速编译的速度，建议使用。

转到caffe的目录

$ sudo make all -j8$ sudo make test -j8$ sudo make runtest -j8

编译Python和Matlab用到的caffe文件

$ sudo make pycaffe -j8
$ sudo make matcaffe -j8

添加~/caffe/python到$PYTHONPATH：

sudo vi ~/.bashrc

在末尾添加： export PYTHONPATH=/home/xuhang/Fiels/caffe-master/python:$PYTHONPATH

$ source /etc/profile # 使之生效

重启系统使环境变量完全生效
8.使用MNIST数据集进行测试

Caffe默认情况会安装在$CAFFE_ROOT，就是解压到那个目录，例如：$ home/username/caffe-master，所以下面的工作，默认已经切换到了该工作目录。下面的工作主要是，用于测试Caffe是否工作正常，不做详细评估。具体设置请参考官网：http://caffe.berkeleyvision.org/gathered/examples/mnist.html

1. 数据预处理

$ sh data/mnist/get_mnist.sh

2. 重建lmdb文件。Caffe支持多种数据格式输入网络，包括Image(.jpg, .png等)，leveldb，lmdb，HDF5等，根据自己需要选择不同输入吧。

$ sh examples/mnist/create_mnist.sh

生成mnist-train-lmdb 和 mnist-train-lmdb文件夹，这里包含了lmdb格式的数据集

3. 训练mnist

$ sh examples/mnist/train_lenet.sh



在编译python文件时，可能会出现错误

ImportError: No module named yaml

解决方法：在命令行中输入

 sudo apt-get install python-yaml