如何制作SDTM Annotated CRF - 1. 指导原则

来源:互联网 发布:sublime text js 补全 编辑:程序博客网 时间:2024/06/14 20:31

指导原则: Metadata Submition Guidelines v1.0

原材料/工具: blank CRF, Adobe Acrobat XI pro(或其他版本的pdf编辑器)

本文以下提到的例子可下载于CDISC官网 - Metadata Submission Guideline (MSG) for SDTMIG

http://www.cdisc.org/standards/foundational/study-data-tabulation-model-implementation-guide/metadata-submission


Study Data Tabulation Model Metadata Submission Guidelines (SDTM-MSG) V1.0 - Section 4: Guidelines for Annotating and Bookmarking CRFs中介绍了关于aCRF提交的标准, 翻译如下(非专业翻译,如有歧义, 以英文原版为准)


4.1 注释的基本原则

Sponsor可以选择任何可行的工具来生成注释。不论采用何种工具,都应当保证可搜索性(基于文本), 以便于审阅。 blankcrf.pdf支持了审阅流程,而aCRF应当反映SDTM中用于提交的数据。如果某个变量的数据计划被收集,但实际中没有收集,aCRF中则会表明这个数据是需要提交的。没有必要重新注释blankcrf.pdf来表明数据没有收集。Sponsor可以选择在Reviewers' Guide中来添加此信息。对于sponsor用来做数据管理的operational data的注释,不应当包含在用于提交的blankcrf.pdf中。


4.1.1 注释唯一的CRF页

目前一些sponsor将全部病案簿包括到blankcrf.pdf中,而另外一些只保留唯一的form. 传统的CRF注释方法可能不适用于注释电子CRF(eCRF)。 比如, 当Vital signs form在10次访视中都要使用时,在纸质版的病案簿中需要有10页相同的form以供记录。 而在eCRF中只需要设计一个电子的Vital signs form, 并在每次访视的数据收集中呈现一次,一共10次即可。


blankcrf的目的是展示试验中收集的数据,以及其在SDTM中所属的位置。推荐使用“双重书签”(See section 4.2)以及TOC(Table of content),这样可以让reviewer对于试验数据收集有一个宏观的概览。基于此前提提出如下注释指导方针:
   
    × 只包含并注释唯一的form。 可以多次使用书签来反映数据是如何在site收集的。 例如, 尽管“Vital signs”在访视1,3,5都需要记录,但是这三个书签都只需要关联到一个唯一的vital signs页上。

    × 如果sponsor选择提交完整的CRF, 那么sponsor应当在各变量第一次出现的时候做注释即可。 后续的重复页不需做注释,或者关联到其第一次出现的位置。 Section 4.2提到的双重书签可以用来定位后续重复出现的内容。 同样以上面提到的vital sign为例, 访视1,3,5连接到对应的pdf页上, 但只在第一次出现的页上做注释。


当使用浏览器审阅时,define.xml的“Origin”列应当链接到有注释的crf页上。 可以参考文档中的例子。

当CRF中收集的数据不需要提交到SDTM时,Metadata team推荐在CRF中加入注释文本“NOT SUBMITTED”。例如,对于一些操作需要而设计的数据,比如问题“Did subject take any concomitant medications?”需要注释为“NOT SUBMITTED”,并且该数据不会出现在SDTM中。需要在文本两边加上方括号(“[NOT SUBMITTED]”)。方括号不是必须的,但是有助与区分提交的数据与非提交的数据。如果有数据集由于没有收集到数据(数据集为空)的原因而未被提交,aCRF中需要展现这一数据的注释;在数据收集后没有必要为了显示某数据没有收集,而返回到CRF中改变注释。

Note:FDA推荐使用措词"Not entered in database",但是,Metadata team推荐使用措词“NOT SUBMITTED”,因为数据有可能在sponsor的处理数据集中有收集,但是不适合提交到SDTM中(如,“Were there any adverse events?”)

4.1.2 注释的外观
aCRF应当符合FDA Study Data Specifications。并且,注释中的所有表示变量和域名的文本应当大写。如果可能的话,注释应当避免遮挡CRF中的文本。Sponsor可以基于CRF的布局来调整域名注释。 

每个CRF中表示的域都应当在CRF也的左侧做出注释,包括2个字母代表域的代码缩写,以及域名 (e.g. IE = Inclusion/Exclusion)。 需要注意,要注释的是域名,而不是数据集的名称。SUPPQUAL数据集的名称不需要注释,因为SUPPQUAL变量会在其对应的域中做出注释。这一原则同样适用于分裂的域,即注释域名,而非数据集名称

以下的推荐为可选择的,有助于reviewer区分域和变量
    * 对于域的注释文本,可以使用稍大的字体,以区分其和变量的注释
    * 如果在一页中存在多于一个domain及其变量需要注释,需要用不同的颜色来区分。例如,对于Demographics的CRF。对于一个特定的域,如果其在不同的CRF页中出现,没有必要遵循同一个颜色框架。在整个CRF页中可以使用一个标准的默认颜色框架。 如果一页中有超多个SDTM域,那么颜色的区分作用可能不是很明显,但是在大多数情况下,这种用颜色区分的做法可使注释的效果更加清晰。

4.1.3 注释发现类的域
由于SDTM发现类的域的结构是垂直的,因而有必要对“--TESTCD”的值加以注释。例如,仅注释VSORRES或VSORRESU是不充分的;有必要同时表明数值和单位对应的VSTESTCD。当注释“Systolic Blood Pressure”时,推荐使用的格式是"VSORRES/VSORRESU when VSTESTCD =SYSBP"。对于具体的注释例子,参见文档中的blankcrf.pdf

4.1.4 注释SUPPQUAL变量
注释QNAM的值和SUPPQUAL数据集的名称,比如“RACEOTH in SUPPDM”. 这种做法的依据是,review工具将带有对应行的SUPP数据的值加入到母域中,并且reviewer仅需要知道变量的名称及其来源于SUPP数据集

4.1.5 注释RELREC记录
CRF中收集的关联数据以及RELREC中所列的数据应当注释。在文档中的例子中,不良事件收集在AE的CRF中,其编码为running records,AE number对应到AESPID。如果一个subject由于AE而中断试验,那么通过在Termination页上录入相关联的AE number(AESPID),可以建立关联记录。RELREC通过AESPID记录建立了DS(由于AE而中断)和AE(AE事件)之间的联系。该关联记录在Termination也中,注释文本为 “Linked to related AE record via RELREC.” 需要注意RELREC的注释体现在Termination页中,而非其来源所在的AE页中。

4.2 CRFs/eCRFs书签
aCRF需要以两种形式制作书签(双重书签):按时间点排序的书签,通常与试验计划访视类似;以及按CRF主题或form排序。SDTM域与CRF主题互相之间不必一一对应。比如,在aCRF中,DM和SC收集于Demography面板上,而SC也收集于Enrollment Form和Demography页。制作双重书签的目的是为了方便reviewer在uniqueCRFs中通过时间点或CRF主题来查询。CRF主题和SDTM域之间不必是一一对应的关系。
    * 时间点书签应当根据试验的时间和事件日程的顺序排列。在每个时间点中,主题书签应当按其在aCRF中出现的顺序排列。
    * 主题书签应当按字母表顺序排列。在每个主题数千种,所有时间点应当按照时间和事件日程顺序排列。

4.3 aCRF的目录
书签对于reviewers起到了目录(Table of Contents; TOC)的作用。尽管其不是必须的,在aCRF的开始可以加入可打印的TOC。这样做可以方便reviewers用打印版的CRF审阅,同时也与电子版本中的书签起到相同作用。有多种商业版本的PDF工具可以根据书签来创建TOC。但是,使用文字处理软件来创建TOC也是可行的,正如文档中的例子。此外,TOC应当超链接到对应页上。


其他参考材料:
搜狐公众平台(《临床研究数据标准化,你还需要理解下注释CRF!》)http://mt.sohu.com/20151217/n431648704.shtml



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