Physionet

生物医学信号有很多处理包：PhysioToolKit（主要用这个处理包来处理数据）、EEGLAB

PhysioToolKit简介：

PhysioToolKit 是一个庞大且不断扩充的软件库，包含了多种软件包：
（1）WFDB(waveform database) 数据库开发工具包，用于读取和分析PhysioBank 数据库。
（2）仿真软件，人工合成的各种动力学波形，用于算法分析和模型评估。
（3）绘图软件， 将文本或二进制数据绘成高品质的图形。
（4）生理信号处理软件，提供了一些通用的信号处理算法。
（5）心率变异性 (Heart Rate Variability, HRV) 分析软件。
（6）时间序列的非线性分析软件。

WFDB 软件包是用来读取和分析PhysioBank 中数据库的开放源码的软件，可在 Linux 、Unix 、Mac 、 Windows 等操作系统下运行。
WFDB 软件包由WFDB Library 、 WFDB Application和 WAVE 三部分组成。

WFDB Library

是用来读、写信号文件、注释文件、头文件的函数集合。这些函数可在用户以 C 、Fortran 、 Java 、 Matlab 等语言编写的程序中调用，从而读取 PhysioBank文件进行数据分析、 以新记录文件或注释文件的形式生成分析结果，这不仅为用户节省了大量的时间和精力，而且可随时为数据库增加新的内容。

WFDB Application

是一个经过测试的命令工具集，用于信号分析和处理。
不同数据格式间的转换 （a2m 、ahaconvert 、 m2a 、edf2mit 、 mit2edf ）
信号校准（calsig ）
波形检测和定位（ecgpuwave 、 sqrs 、wabp 、 wqrs ）
心率和功率谱分析（ihr 、hrfft 、 hrlomb 、 hrmem ）
信号处理（ fft 、fir 、 mfilt 、 dfa ）
信号分析（sigamp 、sigavg 、 signame 、sampfreq ）
注释文件操作 （rdann 、 wrann 、sumann 、 ann2rr 、rr2ann 、 mrgann ）
绘图（ plot2d 、 plot3d 、 plt 、 pltf 、 imageplt ）
数据库文件操作（ wfdbcat 、wfdbcollate 、 wfdbconfig 、wfdbdesc ）等功能

WAVE

是用于波形分析、显示和注释编辑的窗口应用程序，主要功能有
(1) 快速显示不同校准尺度下的波形和注释；
(2) 快速定位到记录的任何一位置， 通过存贮历史数据、提前预读等方式，提高程序运行效率和缩短网络传输时间；
(3) 向前和向后搜索特定的注释类型；
(4) 使用标准的或用户自定义的注释来编辑图形化注释；
(5) 采用不同的波形显示速度，可仿真示波器显示，能够前进或后退；
(6) 高清晰打印用户选择的信号段；
(7) 灵活控制与外部程序的接口来处理和分析信号；
(8) 提供远程操作模式，通过浏览器外部程序进行wave 的波形显示；
(9) 提供在线帮助。、

WFDB用法 :

Object

1. Record

def __init__(self, p_signals=None, d_signals=None,             recordname=None, nsig=None,             fs=None, counterfreq=None, basecounter=None,             siglen=None, basetime=None, basedate=None,             filename=None, fmt=None, sampsperframe=None,             skew=None, byteoffset=None, adcgain=None,             baseline=None, units=None, adcres=None,             adczero=None, initvalue=None, checksum=None,             blocksize=None, signame=None, comments=None)

import wfdbrecord1 = wfdb.Record(recordname='r1', fs=250, nsig=2, siglen=1000, filename=['r1.dat','r1.dat'])

2.MultiRecord

def __init__(self, segments = None, layout = None,             recordname=None, nsig=None, fs=None,             counterfreq=None, basecounter=None,             siglen=None, basetime=None, basedate=None,             segname = None, seglen = None, comments=None)

import wfdbrecordM = wfdb.MultiRecord(recordname='rm', fs=50, nsig=8, siglen=9999, segname=['rm_1', '~', rm_2'], seglen=[800, 200, 900])recordL = wfdb.rdsamp('s00001-2896-10-10-00-31', m2s = False)recordL = recordL.multi_to_single()

3.Annotation

def __init__(self, recordname, annotator, annsamp, anntype, subtype = None,             chan = None, num = None, aux = None, fs = None, custom_anntypes = None)

import wfdbann1 = wfdb.Annotation(recordname='ann1', annotator='atr', annsamp=[10,20,400],                       anntype = ['N','N','['], aux=[None, None, 'Serious Vfib'])

Reading Signals

1.rdsamp