HDU 2457 DNA repair（AC自动机 + DP 入门）

题目链接：Click here~~

题意：

给 n 个带疾病的 DNA 串，然后给一个主串，问如何修改主串中最少个数的字符，使得主串中不包含带疾病的 DNA 串。

解题思路：

令 dp[i][j] 表示长度为 i，位于自动机中节点 j 的所需要修改的最少字符数。

每次转移时枚举下一个可能出现的字符，判断之后会到达的节点，只要不会包含带疾病的 DNA 串就可以进行转移。

#include <queue>#include <stdio.h>#include <string.h>#include <algorithm>using namespace std;#define CLR(a,v) memset(a,v,sizeof(a))namespace Trie{    const int N = 1005;    const int Size = 4;    int top;    struct Node{        Node *next[Size], *f;        //int ended_cnt;        int ended_val;    }node[N], *root;    inline int get_id(char c)    {        if(c == 'A')    return 0;        if(c == 'G')    return 1;        if(c == 'C')    return 2;        if(c == 'T')    return 3;        return 5;    }    inline Node* new_node()    {        //node[top].ended_cnt = 0;        node[top].ended_val = 0;        CLR(node[top].next,NULL);        return &node[top++];    }    void init()    {        top = 0;        root = new_node();    }    void insert(char *s,int val=1)    {        Node *u = root;        for(int i=0;s[i];i++)        {            int id = get_id(s[i]);            if(u->next[id] == NULL)                u->next[id] = new_node();            u = u->next[id];        }        //u->ended_cnt++;        u->ended_val = val;    }}namespace ACam{    using namespace Trie;    void get_fail()    {        queue<Node*> Q;        for(int i=0;i<Size;i++)        {            Node *&ch = root->next[i];            if(!ch)                ch = root;            else            {                ch->f = root;                Q.push(ch);            }        }        while(!Q.empty())        {            Node *cur = Q.front();Q.pop();            for(int i=0;i<Size;i++)            {                Node *&ch = cur->next[i];                if(!ch)                    ch = cur->f->next[i];                else                {                    ch->f = cur->f->next[i];                    ch->ended_val |= ch->f->ended_val;                    Q.push(ch);                }            }        }    }    int dp[N][N];    int solve(char *s)    {        int n = strlen(s);        memset(dp,63,sizeof(dp));        const int inf = dp[0][0];        dp[0][0] = 0;        for(int i=0;i<n;i++)        {            for(int j=0;j<top;j++)            {                if(dp[i][j] == inf)                    continue;                for(int k=0;k<Size;k++)                {                    int jj = node[j].next[k] - node;                    if(node[jj].ended_val)                        continue;                    dp[i+1][jj] = min(dp[i+1][jj],dp[i][j] + (get_id(s[i]) != k ? 1 : 0));                }            }        }        int ans = inf;        for(int j=0;j<top;j++)            ans = min(ans,dp[n][j]);        return ans == inf ? -1 : ans;    }}char str[1005];int main(){    int n, ncase = 0;    while(~scanf("%d",&n),n)    {        ACam::init();        for(int i=0;i<n;i++)        {            scanf("%s",str);            ACam::insert(str);        }        ACam::get_fail();        scanf("%s",str);        int ans = ACam::solve(str);        printf("Case %d: %d\n",++ncase,ans);    }    return 0;}