链特异性转录组测序
来源:互联网 发布:log4j源码讲解 编辑:程序博客网 时间:2024/04/30 16:02
常规转录组测序首先将mRNA片段化,然后采用随机引物进行cDNA双链的合成。因此,常规转录组在测序序列中不能提供链方向的特征信息,很难确定反义转录本,且不能真实的反映转录情况。
链特异性转录组测序(ssRNA-SEQ)是指在构建测序文库时,利用高保真Taq酶将mRNA链的方向信息保存到测序文库中。测序后的数据分析可确定转录本是来自正义还是反义DNA链。与普通转录组测序相比,它更能准确地统计转录本的数量和确定基因的结构,同时可以发现更多的反义转录本,目前被广泛地应用于研究基因结构和基因表达调控等领域范围。
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